RegulaciĆ³n de los niveles intracelulares del represor transcripcional Fur de Acidithiobacillus ferrooxidans

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Fecha
2011
Facultad/escuela
Idioma
es
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Editor
Universidad AndrƩs Bello
Nombre de Curso
Licencia CC
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Resumen
El hierro es un nutriente esencial para todos los organismos, pero en exceso conduce a daƱo macromolecular vĆ­a estrĆ©s oxidativo (reacciĆ³n de Fenton). El regulador transcripcional Fur (Ferric Uptake Regulator) ha sido mostrado de ser el responsable en coordinar los procesos fisiolĆ³gicos involucrados en la captaciĆ³n, incorporaciĆ³n y almacenamiento (homeostasis) de hierro en todas las bacterias Gram negativas estudiadas a la fecha. At. ferrooxidans, una bacteria Gram negativa, es un interesante e inusual modelo para estudiar la homeostasis de hierro debido a que vive a pH 2 donde la biodisponibilidad de hierro es muy alta, y porque ademĆ”s necesita balancear el uso de hierro como un micronutriente versus su uso como fuente de energĆ­a. En muchos organismos estudiados, Fur ha sido encontrado en elevados niveles intracelulares pero muy poco es conocido sobre los mecanismos moleculares involucrados en la regulaciĆ³n de su expresiĆ³n. En esta tesis, se observĆ³ que los niveles de Fur en At. ferrooxidans varĆ­an dependiendo de la fase de crecimiento en que se encuentre la bacteria, incrementĆ”ndose en fase logarĆ­tmica tardĆ­a. Sin embargo, estos cambios no fueron debidos a variaciones en los niveles de mRNA de Fur AF, que permanecen constantes. TambiĆ©n se determinĆ³ que ambos, el mRNA y la proteĆ­na FurAF, varĆ­an en respuesta a cambios en el sustrato energĆ©tico tilizado en el medio de cultivo, sugiriendo la posibilidad de que estas variaciones se deban a regulaciĆ³n a nivel transcripcional y post-transcripcional. Predicciones bioinformĆ”ticas de sitios de uniĆ³n a factores de transcripciĆ³n en la regiĆ³n promotora de furAF, o cercana a Ć©sta, junto a los ensayos in vivo de expresiĆ³n de genes en el sistema heterĆ³logo de E. coli son consistentes con la idea de que furAF puede ser transcrito por la RNA polimerasa asociada a diferentes factores sigma, incluyendo sigma70, sigma32 y sigma54. Predicciones bioinformĆ”ticas tambiĆ©n sugieren que la transcripciĆ³nde furAF podrĆ­a ser regulada por el activador CRP (CAP) indicando un potencial nexo entre el metabolismo del carbono y la homeostasis de hierro. El anĆ”lisis de estabilidad del mRNA de furAF mostraron que Ć©ste posee una elevada vida media de 0,5-4 horas (comparada con 1-20 minutos para un tĆ­pico mRNA), y que su vida media varĆ­a dependiendo del medio de cultivo en que At. ferrooxidans es crecido. AdemĆ”s, se detectĆ³ un RNA, denominado frr, que es transcrito de manera antisentido a fur. AnĆ”lisis de su transcripciĆ³n, incluyendo su sitio promotor y terminador, acoplado con una predicciĆ³n de su estructura secundaria sugieren un modelo en que Frr puede unir el mRNA de FurAF promoviendo el acceso del ribosoma e incrementando los niveles de FurAFĀ· Este es un nuevo mecanismo para la regulaciĆ³n post-transcripcional de Fur.
Notas
Tesis (Doctor en BiotecnologĆ­a)
Palabras clave
Bacterias, TranscripciĆ³n GenĆ©tica, Hierro
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