Caracterización de la expresión de genes del metabolismo de giberelina durante el desarrollo de bayas de uva de mesa
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Fecha
2013
Autores
Profesor/a Guía
Facultad/escuela
Idioma
es
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Editor
Universidad Andrés Bello
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Licencia CC
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Resumen
La uva de mesa es unos de los cultivos más antiguos e importantes del mundo, siendo
uno de los principales productos de exportación de Chile y alcanzando una producción
que convierte a nuestro país en uno los más importantes productores y exportadores a
nivel mundial y el más importante del hemisferio sur (Odepa 201 0), lo que ha fomentado
la necesidad de aumentar su productividad y calidad mediante la investigación de
genes que controlan el desarrollo de uva de mesa.
Un punto de especial interés en el desarrollo de los frutos de la vid es la biosíntesis y
señalización de hormonas vegetales, en la cual las giberelinas se cree tienen un rol
fundamental
Las giberelinas (GAs) son dipertenos tetracíclicos cuya síntesis ocurre por vías
metabólicas muy complejas. Las GAs regulan y tienen una gran influencia en varias
etapas y procesos durante el crecimiento de la planta y de la baya de vid. Se conocen
en la actualidad sobre 130 tipos de GAs, aunque de esas un número muy reducido es
bioactivo. El resto son metabolitos precursores o formas inactivadas de las GAs
bioactivas. Las GAs bioactivas son capaces de incrementar el tamaño de las bayas al
ser aplicadas exógenamente (yVeaver, 1976).
En este trabajo se identificaron y analizaron genes del metabolismo de giberelinas
mediante RNA-seq. Para esto, doce segregantes de una población de 'Ruby Seedless'
x 'Sultanina' fueron seleccionados y muestreados de acuerdo al tamaño contrastante de
sus bayas, en cuatro diferentes estados fenológicos. Luego, se realizó RNAseq de
estas muestras. Un total de cuatro genes (VvGA2ox2, VvGA3ox4, VvGA20ox2 y
VvGA20ox4) fueron seleccionados de acuerdo a sus niveles de expresión diferencial
entre las muestras. Estas diferencias en la acumulación de transcrito entrega
información acerca de los cambios en la expresión genica que ocurre durante el
desarrollo de la baya.
Nota: resumen extraído de un programa de reconocimiento de texto, fórmulas pueden contener inexactitudes, consulte el texto original.
Table grape is one of the oldest and most important crops in the world and is Chile's main fruit product for export. This make Chile one of the most important producer and exportar worldwide (Odepa 201 0). This situations has resultad in the need to increase productivity and quality of table grapes by research of genes controlling their development. An special point of interest in grape development is phytohormone biosynthesis and its signaling, in which gibberellins are thought to play a crucial role. Gibberellins (GAs) are tetracyclic diterpenes whose synthesis occurs by complex metabolic pathways. GAs regulate and influence several developmental stages of plant growth and berry formation. At present time, over 130 different types of GAs had been described, although only a small number are bioactive with the rest of them acting as precursors or inactiva forms for this bioactive GAs. lt has been reportad in Vitis vinifera that bioactive GAs are able to increase berry size. (VVeaver, 1976). The aim of this work is the identification and analysis of gibberellin metabolism genes by RNA-seq. For this, twelve siblings of a population of 'Ruby Seedless' x 'Sultanina' were selected and sampled according to contrasting berry size on four different phenological stages. Then an RNAseq was performed on this samples. A total of four genes (VvGA2ox2, VvGA3ox4, VvGA20ox2 and VvGA20ox4) were selected considering differential expression level between the samples. The differences between expression levels of this genes offer insight about the changes in genetic expression that occur in berry development.
Table grape is one of the oldest and most important crops in the world and is Chile's main fruit product for export. This make Chile one of the most important producer and exportar worldwide (Odepa 201 0). This situations has resultad in the need to increase productivity and quality of table grapes by research of genes controlling their development. An special point of interest in grape development is phytohormone biosynthesis and its signaling, in which gibberellins are thought to play a crucial role. Gibberellins (GAs) are tetracyclic diterpenes whose synthesis occurs by complex metabolic pathways. GAs regulate and influence several developmental stages of plant growth and berry formation. At present time, over 130 different types of GAs had been described, although only a small number are bioactive with the rest of them acting as precursors or inactiva forms for this bioactive GAs. lt has been reportad in Vitis vinifera that bioactive GAs are able to increase berry size. (VVeaver, 1976). The aim of this work is the identification and analysis of gibberellin metabolism genes by RNA-seq. For this, twelve siblings of a population of 'Ruby Seedless' x 'Sultanina' were selected and sampled according to contrasting berry size on four different phenological stages. Then an RNAseq was performed on this samples. A total of four genes (VvGA2ox2, VvGA3ox4, VvGA20ox2 and VvGA20ox4) were selected considering differential expression level between the samples. The differences between expression levels of this genes offer insight about the changes in genetic expression that occur in berry development.
Notas
Tesis (Magister en Biotecnología)
Palabras clave
Giberelinas, Pruebas, Vid