Estudio de expresión y función de un elemento parvoviral endógeno en el genoma de la chinchilla (chinchilla lanigera)
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Fecha
2023
Autores
Profesor/a Guía
Facultad/escuela
Idioma
es
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Editor
Universidad Andrés Bello
Nombre de Curso
Licencia CC
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Resumen
Los Elementos Virales Endógenos (EVEs) son secuencias de DNA provenientes de genomas, genes o fragmentos de genes virales que se han integrado en el genoma de otros organismos. Se ha planteado que podrían ser considerados registros fósiles de infecciones virales ocurridas hace millones de años, y se ha demostrado que en ciertos organismos estos elementos virales tienen funciones biológicas. Por ello, su estudio es relevante para la comprensión de la co-evolución de virus y organismos uni- y pluri-celulares.
A partir de estudios in silico, se describió la presencia de un EVE en el genoma de la chinchilla de cola larga (Chinchilla lanigera), con alta similitud con un gen que codifica para la proteína no estructural de un virus de la familia Parvoviridae. En esta investigación se estudió la expresión y función de este EVE presente en el genoma de C. lanigera, a través de su clonamiento, el análisis de su expresión en sistemas heterólogos, su localización subcelular y la identificación de su posible actividad antiviral. Además, se contribuyó a caracterizarlo en cuanto ORF intacto, a partir del genoma de referencia existente en GenBank. De aquí en adelante nos referiremos a este EVE como CL4-enRep, por replicasa endógena de C. lanigera.
A partir del DNA genómico de chinchilla se clonó CL4-enRep, que contiene un marco de lectura abierto de 1561 pb. Posteriormente se generó una línea celular estable que permitió ensayos de expresión de la proteína codificada por esta secuencia en células eucariontes, analizados mediante western blot e inmunofluorescencia. Finalmente, la línea celular fue desafiada con un parvovirus exógeno para evaluar la posible actividad antiviral de la proteína. Se concluyó que CL4-enRep puede expresarse como proteína en un sistema heterólogo, que tiene localización nuclear y carece de actividad antiviral.
Notas
Tesis (Licenciado en Biología)
Este trabajo contó con financiamiento del FONDECYT 1220480 y del Apoyo a la realización de actividades de Investigación en la etapa de Pre-grado (APP-1 2023) de la Vicerrectoría de Investigación y Doctorado de la Universidad Andrés Bello.
Este trabajo contó con financiamiento del FONDECYT 1220480 y del Apoyo a la realización de actividades de Investigación en la etapa de Pre-grado (APP-1 2023) de la Vicerrectoría de Investigación y Doctorado de la Universidad Andrés Bello.
Palabras clave
Chinchillas, Genética, Elemento Viral Endógeno.