Castro Nalla, EduardoPieringer, HansMoreno, AndreaToro, MagalyTichy Navarro, Daniel AlfredoFacultad de Ciencias de la VidaEscuela de Ingeniería en Biotecnología2023-07-312023-07-312018https://repositorio.unab.cl/xmlui/handle/ria/52108Proyecto de tesis (Magíster en Biotecnología)La producción industrial de cerdos en Chile está sujeta a la aplicación de medidas y normativas sanitarias exigentes. Sin embargo, es frecuente la aparición de brotes de enfermedades infecciosas de origen bacteriano, entre la que destaca la colibacilosis porcina. Esta enfermedad es causada por Escherichia coli (E. coli), una bacteria que infecta el tracto intestinal de lechones neonatos y de cerdos post-destetados, con una morbilidad de 50% y una mortalidad de 5%, cuyo impacto se traduce en pérdidas de USD$55 millones al año de acuerdo con estimaciones de los productores locales. Las subespecies de E. coli que provocan colibacilosis porcina son aquellas cepas clasificadas como E. coli enterotoxigénicas (ETEC), que se caracterizan por sintetizar enterotoxinas que alteran el equilibrio osmótico de las células epiteliales del intestino e inducen diarreas acuosas. En Chile, los productores aplican programas de profilaxis y metafilaxis basados en el uso de antibióticos y de vacunas diseñadas contra antígenos específicos a partir de la información epidemiológica internacional. Sin embargo, éstos no han cumplido los objetivos para los cuales fueron implementados, ya que se observa que los índices de morbilidad y mortalidad asociados a colibacilosis porcina siguen superando ampliamente la media mundial. Por lo tanto, se identificó la necesidad de caracterizar exhaustivamente las cepas de ETEC presentes en la industria local. Este trabajo tuvo por objetivo caracterizar los elementos determinantes del serotipo, los factores de virulencia, los genes de resistencia a antibióticos y la relación evolutiva de una colección de ETEC aisladas desde fecas de lechones neonatos y post-destetados de granjas industriales en Chile. Se obtuvieron 76 aislados positivos para enterotoxinas a partir de muestras fecales de 133 animales de 6 granjas distintas. Se secuenciaron los genomas y se determinaron in silico los factores determinantes del serotipo, factores de virulencia y genes de resistencia a antibióticos. Los resultados obtenidos indican la presencia de 12 cepas distintas, distribuidas entre las granjas analizadas; cinco toxinas intraintestinales diferentes en distintas combinaciones; nueve perfiles de resistencia a 8 grupos de antibióticos distintos, entre los que destacan múltiples perfiles de multi-resistencia. Además, se evidenció la existencia de múltiples eventos de introducción de ETEC exógenas. Dadas las características genéticas de las cepas ETEC aisladas desde granjas industriales de cerdos en Chile, se puede concluir que estas son distintas a las principales cepas asociadas a la enfermedad a nivel mundial.esEscherichia ColiGenómicaCerdosProductividadChileTesis