Valenzuela Valdés, PabloMolinett Soto, SebastiánFacultad de Ciencias Biológicas2017-08-112017-08-112013http://repositorio.unab.cl/xmlui/handle/ria/3911Tesis (Doctor en Biotecnología)La levadura induce reprogramaciones transcripcionales para tolerar el desafiante y a la vez, cambiante ambiente que se desarrolla durante la fermentación alcohólica. Los mecanismos sistémicos que controlan este proceso no han sido completamente dilucidados. En este trabajo, datos del transcriptoma de la levadura obtenidos por análisis seriado de expresión génica (SAGE) revelaron actividad transcripcional en regiones intergénicas, mediante mapeo de etiquetas NORF (regiones de lectura no abiertas). El ARN no codificante largo de tipo intergénico con la mayor sobre-expresión en la fase estacionaria tardía de la fermentación alcohólica, fue caracterizado por estudios fisiológicos y por análisis transcriptómico de microarreglos en una cepa mutante nula para este ARN. Las evidencias sugieren que este ARN no codificante participa en la modulación de la actividad regulatoria de los factores de transcripción ADR1 y AFT2, los cuales cumplen un papel relevante durante la fase estacionaria de la fermentación alcohólica, la que se asocia con condiciones estresantes, tales como agotamiento de nutrientes y concentraciones tóxicas de etanol. Además, desde este conjunto de datos fueron descubiertos ARNs de antisentido (asARN) y luego caracterizados funcionalmente. En su conjunto, las evidencias sugieren fuertemente que estos ARNs no codificantes corresponden a asARNs que juegan un rol regulatorio en la fase estacionaria de la fermentación alcohólica mediante el silenciamiento de genes diferencialmente expresados en S. cerevisiae. Estos genes están involucrados en metabolismo respiratorio y la composición de la membrana, los cuales podría estar implicados en procesos de adaptación a las condiciones estresantes de la fase estacionaria de la fermentación.Yeast induces transcriptional reprogramming to tolerate the increasingly challenging environment that develops during alcoholic fermentation . Systemic mechanisms that control this process are not fully understood yet. In this work, serial analysis of gene expression (SAGE) transcriptomic data revealed , by NORF (Non Open Reading Frame) tags mapping , transcriptional activity across long intergenic regions. The long intergenic non-coding (nc) RNA up-regulated highest at late-stationary phase was characterized by microarray experiments, performed in a yeast strain knock out for this RNA. The evidences suggest that this ncRNA participates in the modulation of the activity of regulatory transcription factors ADR1 and AFT2 during stationary phase of alcoholic fermentation, which is associated with stressing conditions, such as nutrient depletion and toxic ethanol levels. Furthermore, antisense (as) RNAs were discovered from this data set and then functionally characterized. Altogether, the evidences strongly suggest that these ncRNAs are asRNAs that play a regulatory role at late-stationary phase of alcoholic fermentation by silencing of specific differentially expressed genes S. cerevisiae. These genes are involved in respiratory metabolism and membrane composition, which might have implications in adaptation process to stressing conditions from stationary phase.esLevadurasGenéticaSaccharomyces CerevisiaeTesis