Localización y orientación de la proteína FAM162A en las mitocondrias
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Fecha
2023
Autores
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Idioma
es
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Editor
Universidad Andrés Bello
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Licencia CC
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Resumen
Las proteínas cumplen múltiples funciones en los seres vivos, participando como pilar estructural
y funcional en los órganos, con una destinación especifica al sitio donde con una unión selectiva a
otras moléculas podrán cumplir prácticamente las funciones de una célula o tejido. Las proteínas
pueden encontrarse solubles en el citosol, al interior de organelos o embebidas en las membranas
celulares. La correcta localización y orientación de las proteínas en el ambiente celular es
determinante para su función.
FAM162A es una proteína de membrana, de 154 aminoácidos, 17.3 KDa, que localiza en las
mitocondrias, y que pertenece a la familia de las proteínas BH3-only. Su función está asociada a la
apoptosis inducida por hipoxia y a la mitofagia, no obstante, el mecanismo de acción de FAM162A
asociado a la mitofagia es desconocido. Análisis bioinformáticos de FAM162A sugieren la
presencia de dos segmentos transmembrana, uno de ellos en el extremo N-Terminal; un dominio
BH3; un dominio DID, asociado a muerte celular; y tres dominios LIR, que permitirían la
interacción con la maquinaria citosólica de autofagia. De los tres dominios LIR, uno se encuentra
en el extremo N-Terminal (posición 52-58), y los otros dos en el segmento transmembrana
(posición 101-121). En la literatura, se propone un modelo estructural y topológico de FAM162A
que la sitúa en la membrana externa mitocondrial y con su N-Terminal en el espacio
intermembrana. Esta configuración no se condice con la presencia del dominio LIR 52-58, el cual
debe posicionarse en el citosol para su interacción con la maquinaria de autofagia, al igual que
otras proteínas BH3 asociadas a la autofagia como NIX y BNIP3, por lo que es necesario abordar
empíricamente de la topología y orientación de FAM162A. Se hipotetiza entonces que FAM162A
se encuentra en la membrana externa de las mitocondrias con su N-terminal orientado hacia el
citosol y C-terminal hacia el espacio intermembrana.
Los objetivos específicos son identificar en qué membrana de la mitocondria se localiza FAM162A
y su orientación. El diseño experimental y metodológico comprende ensayos de protección a
proteasa donde los extremos N- y C-Terminal de FAM162A son marcados con GFP para
microscopía fluorescente; o con la marca c-myc para Western blot. Los resultados obtenidos, y de
manera inesperada, sugieren que FAM162A localiza en la membrana interna mitocondrial con su
dominio LIR situado en el espacio interno de las crestas mitocondriales y/o en el espacio
intermembrana. Tanto los extremos N- y C-terminal estarían en la matriz mitocondrial, sugiriendo
que FAM162A es una proteína con dos segmentos transmembrana. Esta localización de FAM162A
sugiere un nuevo mecanismo de regulación de la mitofagia que podría actuar en condiciones
severas de estrés que impliquen la ruptura de la membrana externa mitocondrial.
Notas
Tesis (Magíster en Biotecnología y Ciencias de la Vida)
Palabras clave
Proteínas, Mitocondrias