Examinando por Autor "Deupi, Xavier"

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    Estudio de los micro-dominios funcionales e interacción con ligandos en receptores acoplados a proteínas G (GPCRs) mediante herramientas bioinformáticas
    (Universidad Andrés Bello, 2012) González Wong, Angel; Pérez-Acle, Tomás; Deupi, Xavier
    Los receptores acoplados a proteínas G (GPCRs) constituyen una de las mayores familias de proteínas integrales de membrana en mamíferos. Estos receptores participan de la traducción de numerosas señales endógenas y exógenas en respuestas celulares, formando parte de un complejo sistema de señalización que involucra una enorme diversidad de ligandos y otras proteínas celulares. A pesar de la baja identidad de secuencia que hay entre los miembros de la familia de GPCRs, existe una elevada similitud estructural, caracterizada por una arquitectura molecular conservada de siete segmentos alfa hélice de transmembrana (7 TM). El presente trabajo de investigación se enfoca al estudio de esta arquitectura molecular de 7 TM en cuanto a su comportamiento dinámico, modos de interacción con ligandos y sensibilidad estructural a los efectos de mutaciones. Para realizar esta investigación se han utilizado de manera sistemática un conjunto de herramientas y metodologías de biología computacional. Los resultados teóricos obtenidos han sido contrastados con datos experimentales de la literatura y de colaboraciones con otros grupos de investigación. De esta manera, se han caracterizado mediante simulaciones computacionales los diversos micro-dominios funcionales en la estructura del receptor cannabinoide tipo 1 (CB,) humano relacionados a la activación e interacción con ligandos. También se describen las bases moleculares del proceso de disociación de ligandos y los potenciales sitios alostéricos identificados en las estructuras de los receptores beta-adrenérgicos tipo 1 y 2 (61- f32AR) humanos. Por otro lado, se ha empleado de manera exitosa el efecto de la solvatación en el diseño de ligandos sintéticos para incrementar su afinidad de unión por el receptor de serotonina tipo 4 (5HT4R). Finalmente, se ha identificado y caracterizado a nivel estructural una nueva mutación en el receptor de melanocortina tipo 2 humano (MC2R) asociada a una patología de deficiencia familiar de glucocorticoides. Los resultados teóricos obtenidos revelan numerosas propiedades de la arquitectura 7 TM que resultan cruciales en los mecanismos de activación y unión a ligandos en los GPCRs y ponen de manifiesto la enorme utilidad de los métodos de biología computacional en el estudio de esta familia de receptores.