Examinando por Autor "Krauskopf, Erwin"

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    A bibiliometric analysis of the Journal of Infection and Public Health: 2008–2016
    (Elsevier Ltd, 2018-03) Krauskopf, Erwin
    Background: The Journal of Infection and Public Health published its first issue in 2008. The fact that the journal has been published uninterruptedly as well as its editorial content and the application of a peer-review process to select manuscripts, made the journal eligible to be indexed by databases such as Scopus. This study presents a general overview of the journal from 2008 until 2016 using bibliometric indicators to assess its performance. Methods: The data for this study, dating between 2008 and 2016, was extracted from Scopus database. All the information was exported in CSV format to the Sequel Pro software for data analysis. Additionally, collaboration and word co-occurrence networks were generated using VOSviewer. Results: The total number of documents published between 2008–2016 was 586, of which local authorship (Saudi Arabia) constituted a small share, accounting only for 19.3% (113 documents). Those with foreign authorship (other countries excluding Saudi Arabia) represented 80.7% (473) of the total. Furthermore, the three countries that co-author documents with researchers from Saudi Arabia are Egypt, the United States and the United Kingdom. Likewise, these three countries serve as nodes connecting researchers from other countries located in Asia, Africa, Europe and Latin America. An analysis of the top-five journals that cited the research published revealed that that 90.2% of them belonged to the first and second quartiles confirms the quality of the research being published. Word co-occurrence analysis established a slight shift of focus in the research topics published during the last four years studied, as a new cluster was formed with terms related to “education”, “intervention” and “implementation”. Conclusion: The journal has managed, in very few years, to be considered by researchers worldwide. Furthermore, throughout the years, the journal showed an evolution in the main topics covered, providing a contemporary overview of public health. © 2018
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    Aislamiento y caracterización del factor de transcripción ICE1 de Eucalyptus globulus
    (Universidad Andrés Bello, 2011) Rasmussen Poblete, Susana Alejandra; Krauskopf, Erwin; Valenzuela, Pablo
    ICE1 es un factor de transcripción que es activado en respuesta a condiciones de frío en plantas. Es considerado como el componente clave dentro de la cascada de señalización de frío, activando la respuesta mediada por los factores de transcripción de unión a e-repetidos (CBFs) y gatillando la expresión de los genes localizados río debajo de esta cascada. En esta tesis aislamos un cDNA que codifica para la proteína ICE1 de Eucalyptus g/obu/us (Eg/CE1) a partir de una librería de cDNA construida bajo condiciones de frío. La secuencia de cDNA posee un marco de lectura abierto de 1683 pb y codifica para una proteína de 560 aminoácidos, con un peso molecular estimado de 60,48 kDa y un pi calculado de 5,65. La comparación de la secuencia de cDNA con la obtenida a partir de DNA genómico demostró que Eg/CE1 no posee intrones, confirmándose la presencia de todos los dominios característicos de las proteínas ICE1 descritas actualmente. Adicionalmente, encontramos un dominio de activación extra, que probablemente aumenta la actividad del factor de transcripción EglCE1. Este dominio también está presente en proteínas ICE1 de otras especies de Eucalyptus. Ensayos de expresión transientes demostraron que EglCE1 es un factor de transcripción que se une a los promotores de genes CBF, de la misma forma que AtlCE1. EglCE1 es un regulador transcripcional, activando y reprimiendo los promotores de los genes CBFs en respuesta a bajas temperaturas. Los niveles de transcritos de Eg/CE1 aumentaron en respuesta a condiciones de frío y sequía. El análisis de expresión de los genes río abajo demostró que la abundancia relativa de los mRNA de EgCBF1 aumentó sólo en respuesta a bajas temperaturas y no fue detectado en condiciones de sequía. Por otro lado, la abundancia relativa del gen EgRD29B disminuyó en respuesta a bajas temperaturas y aumentó en respuesta a sequía. Por otro lado, los niveles de proteína EgICE1 no variaron en las mismas condiciones. Sin embargo, se demostró que EglCE1 se encuentra fosforilado tanto en frío, sequía y condiciones control. Proponemos que existen eventos de desfosforilación implicados en la regulación post-traduccional en respuesta a condiciones de estrés, pero estro debe ser determinado experimentalmente
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    Análisis bibliométrico de la producción científica de hantavirus en Chile
    (Universidad Andrés Bello, 2017) Salinas del Canto, Valentina Andrea; Krauskopf, Erwin; Facultad de Ciencias Biológicas; Escuela de Ingeniería en Biotecnología
    El Hantavirus es un agente zoonótico de importancia mundial, que provoca en Chile un alto número de casos al año, alcanzando el año 2015 un 43% de desenlace fatal. Además, el hecho de afectar principalmente a los habitantes de zonas rurales y a trabajadores agrícolas y forestales, lo ha convertido en un problema de salud pública. Hasta la fecha, la única forma de controlar la incidencia de esta enfermedad es mediante la prevención de la infección del ser humano, ya que no ha sido posible erradicar el virus. Dado el impacto que genera en nuestro pais, se torna relevante conocer con detalle la producción científica que se desarrolla en Chile en relación a Hantavirus, en comparación a otros países de américa que son afectados por la enfermedad, además de investigar los proyectos relacionados que se están realizando en Chile y quienes son los científicos más destacados en el área, examinando en base a la relevancia y visibilidad que tienen sus artículos. Esta informacion nos permitira generar una serie de recomendaciones a considerar por universidades y organismos como CONICYT.
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    Are we at a turning point in journal assessment? An introduction to altmetrics
    (Universidad Austral de Chile, 2020-09) Krauskopf, Erwin
    The status of any journal in which research is published is an important issue for academics. For many years the impact factor has been the criteria of choice to infer the quality of the research being published by each journal. However, with the massification of the internet, research currently impacts well beyond the academic community. This study aims to introduce readers into other bibliometric and non-bibliometric (altmetric) indicators that provide a wider perspective about the impact any particular research outcome may have besides citations. From a geographic viewpoint, the documents published by AJVS between 2010-2019 were written by authors affiliated to institutions from 33 different countries, mostly from Chile (37%) and Mexico (24%). These two countries served as collaboration nodes for countries from America, Asia, Europe and Oceania. From an altmetric perspective, 59 documents published between 2010-2016 were mentioned at least once in one of the sources tracked, being the majority of them through social media. Of particular interest is one document that was used as a reference for a patent issued in 2017 by researchers that were not related to the document published in the journal. Unfortunately, data for the documents published between 2017-2019 were unavailable, probably due to issues with the journal title change. Nevertheless, it is fair to conclude that since research outputs have shown to have an impact well beyond academia, it may be time to reconsider how journals should be assessed in the near future.
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    Caracterización funcional del gen EgBor1 mediante expresión heteróloga en Saccharomyces cereviseae
    (Universidad Andrés Bello, 2010) Pieringer, Hans; Krauskopf, Erwin; Facultad de Ciencias Biológicas; Escuela de Ingeniería en Biotecnología
    La industria forestal se ha consolidado como la segunda industria más importante del Chile después del cobre. Sus altas tasas de crecimiento han llevado a los actores de esta industria considerar nuevas regiones del país para extender los terrenos comerciales. En esta búsqueda se ha propuesto el norte de Chile como un potencial lugar para el cultivo de especies forestales, debido a la gran cantidad de terrenos disponibles y de muy bajo costo. No obstante, las características edafológicas del norte chileno tales como periodos prolongados con altas temperaturas, un alto grado de sequía, altas concentraciones de sal y boro en el suelo. Estas condiciones dificultan el uso de estos suelos para plantaciones forestales de interés comercial. Eucalyptus globulus es una importante especie forestal de alto impacto económico para el país por el alto valor agregado de su madera. Esta especie ha presentado un crecimiento sostenido durante los últimos seis años lo que en conjunto con las características antes mencionadas, posicionan a esta especie como un interesante objeto de estudio, como potencial candidato de aplicaciones biotecnológicas. Estudios han demostrado que el transportador BORl de Arabidopsis thaliana es el transportador clave en la dinámica de movimiento de boro en la planta, ya que este transportador regula el paso desde el periciclo de la raíz hacia la planta completa. La caracterización funcional de este transportador podría sugerir algún tipo de regulación que permita evitar el efecto tóxico de las altas concentraciones de boro en plantas, para así poder generar soluciones aplicadas para la generación de especies forestales tolerantes a las condiciones del norte de Chile.
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    Caracterización funcional del gen NHX1 de eucalyptus globulus mediante expresión heteróloga en saccharomyces cerevisiae
    (Universidad Andrés Bello, 2009) Rothhammer Llop, Matías Ignacio; Krauskopf, Erwin; Escuela de Ingeniería en Biotecnología
    La proteína NHX1 corresponde a una bomba de Na+/H+ localizada en la membrana vacuolar, que participa en la respuesta a estrés por sal. La secuencia que codifica para la proteína NHX1 de Eucalyptus globulus (EgNHX1) fue amplificada mediante PCR desde un clon de una biblioteca de cONA construida previamente en el laboratorio. Con el fin de determinar la participación de esta proteína en la respuesta a estrés por sal, se expresó la proteína recombinante de Eucalyptus globulus en Saccaromyces cerevisiae utilizando la cepa silvestre HIS5/YIL 116W. Ensayos de crecimiento en presencia de sal muestran que la proteína EgNHX1 no incrementa en forma significativa la tolerancia de la cepa silvestre de S. cerevisiae. Por otra parte, se realizaron ensayos de complementación de mutantes NHX1 de S. cereviseae YDR456W con la proteína EgNHX1, donde se observó una recuperación del fenotipo. Estos resultados sugieren que la proteína NHX1 de Euca/yptus globu/us participa en la respuesta a estrés por sal, puesto que la ausencia en la tolerancia de cepas mutantes es revertida cuando se complementan con la proteína de E. globulus.
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    Desde el muro de Berlín a la internacionalización de la ciencia: Las publicaciones chileno alemanas entre 1975-2014
    (Interciencia Association, 2018-08) Fernández Darraz, Enrique; Krauskopf, Erwin
    En el presente trabajo se analiza la evolución de la colaboración científica chileno-alemana durante el período 1975-2014, a través de publicaciones en coautoría en revistas indexadas por la base de datos Web of Science. Su objetivo es indagar las relaciones científicas entre ambos países, siendo la publicación conjunta un mecanismo certero para medir y cuantificar el contacto e intercambio. Para el análisis, se situó la producción científica en el contexto histórico en que esta colaboración ha tenido lugar. Luego se determinaron las tendencias en términos de volumen y disciplinas científicas. Por último, se identificaron los principales centros que actualmente están colaborando. Se evidencia la creciente orientación de los autores chilenos hacia temas de relevancia internacional, no necesariamente vinculados a áreas de interés científico nacional.
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    Generation and analysis of an Eucalyptus globulus cDNA library constructed from seedlings subjected to low temperature conditions
    (Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, 2008) Rasmussen-Poblete, Susana; Valdes, Jorge; Gamboa, Maria Cecilia; Valenzuela, Pablo D.T.; Krauskopf, Erwin
    Eucalyptus globulus is the most important commercial temperate hardwood in the world because of its wood properties and due to its characteristics for biofuel production. However, only a very low number of expressed sequence tags (ESTs) are publicly available for this tree species. We constructed a cDNA from E. globulus seedlings subjected to low temperature and sequenced 9,913 randomly selected clones, generating 8,737 curated ESTs. The assembly produced 1,062 contigs and 3,879 singletons forming a Eucalyptus unigene set. Based on BLASTX analysis, 89.3% of the contigs and 88.5% of the singletons had significant similarity to known genes in the non-redundant database of GenBank. The Eucalyptus unigene set generated is a valuable public resource that provides an initial model for genes and regulatory pathways involved in cell wall biosynthesis at low temperature.
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    Genomic organization of the rDNA cistron of the teleost fish Cyprinus carpio
    (Sociedad de Biología de Chile, 2003) Vera, María Inés; Molina, Alfredo; Pinto, Rodrigo; Reyes, Mauricio; Álvarez, Marco; Krauskopf, Erwin; Quezada, Claudia; Torres, Jorge; Krauskopf, Manuel
    The seasonal adaptation of the teleost Cyprinus carpio to the cyclical changes of its habitat demands physiological compensatory responses. The process involves profound nucleolar adjustments and remarkable changes in rRNA synthesis, which affects ribosomal biosynthesis. In this context, we have demonstrated that the synthesis of several proteins involved in ribosomal biogenesis as protein kinase CK2, ribosomal protein L41 and nucleolin, as well as U3 snoRNP, are differentially regulated in summer-acclimatized carp compared to the cold-season adapted fish. To understand the mechanisms involved in the seasonal regulation of rRNA gene transcription, we have been studying the carp rDNA cistron structure. Because the cis-elements that regulate the expression of the tandem organized ribosomal genes are located in the non-transcribed intergenic spacer (IGS), we analyzed the primary structure of the carp rDNA gene IGS. The gene organization is similar to that described from other vertebrate species, including numerous repetitive sequences, the transcription start site, and some potential cis-elements such as ribosomal enhancers, proximal terminator and transcriptional terminators. Ribosomal DNA is a remarkable case of gene duplication and has been used as a model to test the concerted evolution theory. We performed sequence comparison analyses of 18S rRNA coding sequences from carp with different species, data with which an unrooted phylogram was constructed.
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    Una mirada epistemométrica de la Revista Médica de Chile y su aporte al conocimiento en Medicina
    (Sociedad Médica de Santiago, 2008) Krauskopf, Manuel; Krauskopf, Erwin
    Background: During the last decade Revista Médica de Chile increased its visibility, measured on citations and impact factor. Aim: To perform a scientometric analysis to assess the performance of Revista Médica de Chile. Material and methods: Thomson's-ISI Web of Science and Journal Citation Reports QCR) were consulted for performance indicators of Revista Médica de Chile and Latin Amerícan journals whose subject is General and Internal Medicine. We also report the h-index of the journal, which infers quality ¡inked to the quantity of the output. Results: According to the h-index, Revista Médica de Chile ranks 4 among the 36 journals indexed and published by Argentina, Brazil, Chile and México. The top ten articles published by Revista Médica de Chile and the institutions with the higher contríbution to the journal, were identified using citations. In the Latin Amerícan región, Brazil relevantly increased its scientific output. However, Argentina, Chile and México maintain a plateau during the last decade. Conclusions: Revista Médica de Chile increased notoriously its performance. Its contríbution to the Chilean scientific community dedicated to Medicine appears to be of central value.
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    More important than the impact factor
    (Springer New York LLC, 2018-02) Krauskopf, Erwin
    he recently published editorial1 about JNC’s impact factor undeniably shows a positive trend in the quality of the published items. Obviously, a journal with a high impact factor will attract more submissions as it is considered more prestigious. However, I believe that JNC should highlight other features that are rarely mentioned while assessing the quality of a journal. For instance, what journals are using the papers published by JNC? From what institutions are the researchers that cite JNC’s papers?..
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    More to see on acta ophthalmologica
    (2015-02) Krauskopf, Erwin
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    Plant Science research productivity in Chile during the past 20 years
    (Sociedad de Biología de Chile, 2008) Krauskopf, Erwin
    The purpose of this study was to carry out a bibliometric analysis of the articles published in Chile during 1987-2006 that were categorized into the Plant Science discipline by ISI. The data was extracted from the Web of Science datábase, obtaining a total of 911 articles for analysis. Almost half of the articles were the outcome of an international collaboration, the United States being the country with more collaborative links with Chile within this discipline. A list was made with the 10 most-cited articles and 10 most frequently used journals. The analysis showed that almost 50% of the articles were concentrated in 10 different journals. The number of articles produced each year revealed a steady growth in scientific production since 1987. This is probably related to the progressive interaction between industry and public-research institutions.
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    Short Term Impact of the Chilean Journal of Agricultural Research: A Bibliometric Analysis
    (Instituto de Investigaciones Agropecuarias, INIA, 2012-03) Krauskopf, Erwin
    In January 2007, the Chilean Journal of Agricultural Research was indexed by the Institute of Scientific Information (ISI). This paper reviews the research that has been published since 2007 by using records extracted from the Web of Science database. The papers published were mostly affiliated to researchers from Chile, and six out of the ten most-contributing countries were from Latin America. The analysis by institutions showed Universidad de Concepcion as the most prolific, although this result is not valid. A lack of standardization in the manner the Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA) subscribed its address on each paper caused a disaggregation of the information. This was proven by the manual curation of each record that was affiliated to any of the centers belonging to INIA. The journal has a self-citation rate of 19.3%, value that is relatively high if compared to other journals from the same subject category listed on The Journal Citation Reports 2010. Finally, this work should be considered a bibliometric snapshot of the current situation of the journal that will serve as a benchmark when new evaluations are made in a few-years time.