Examinando por Autor "Moreno, Andrea"

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    Caracterización genómica de una colección de cepas de escherichia coli enterotoxigénicas obtenidas desde granjas de producción industrial de cerdos en Chile
    (Universidad Andrés Bello, 2018) Tichy Navarro, Daniel Alfredo; Castro Nalla, Eduardo; Pieringer, Hans; Moreno, Andrea; Toro, Magaly; Facultad de Ciencias de la Vida; Escuela de Ingeniería en Biotecnología
    La producción industrial de cerdos en Chile está sujeta a la aplicación de medidas y normativas sanitarias exigentes. Sin embargo, es frecuente la aparición de brotes de enfermedades infecciosas de origen bacteriano, entre la que destaca la colibacilosis porcina. Esta enfermedad es causada por Escherichia coli (E. coli), una bacteria que infecta el tracto intestinal de lechones neonatos y de cerdos post-destetados, con una morbilidad de 50% y una mortalidad de 5%, cuyo impacto se traduce en pérdidas de USD$55 millones al año de acuerdo con estimaciones de los productores locales. Las subespecies de E. coli que provocan colibacilosis porcina son aquellas cepas clasificadas como E. coli enterotoxigénicas (ETEC), que se caracterizan por sintetizar enterotoxinas que alteran el equilibrio osmótico de las células epiteliales del intestino e inducen diarreas acuosas. En Chile, los productores aplican programas de profilaxis y metafilaxis basados en el uso de antibióticos y de vacunas diseñadas contra antígenos específicos a partir de la información epidemiológica internacional. Sin embargo, éstos no han cumplido los objetivos para los cuales fueron implementados, ya que se observa que los índices de morbilidad y mortalidad asociados a colibacilosis porcina siguen superando ampliamente la media mundial. Por lo tanto, se identificó la necesidad de caracterizar exhaustivamente las cepas de ETEC presentes en la industria local. Este trabajo tuvo por objetivo caracterizar los elementos determinantes del serotipo, los factores de virulencia, los genes de resistencia a antibióticos y la relación evolutiva de una colección de ETEC aisladas desde fecas de lechones neonatos y post-destetados de granjas industriales en Chile. Se obtuvieron 76 aislados positivos para enterotoxinas a partir de muestras fecales de 133 animales de 6 granjas distintas. Se secuenciaron los genomas y se determinaron in silico los factores determinantes del serotipo, factores de virulencia y genes de resistencia a antibióticos. Los resultados obtenidos indican la presencia de 12 cepas distintas, distribuidas entre las granjas analizadas; cinco toxinas intraintestinales diferentes en distintas combinaciones; nueve perfiles de resistencia a 8 grupos de antibióticos distintos, entre los que destacan múltiples perfiles de multi-resistencia. Además, se evidenció la existencia de múltiples eventos de introducción de ETEC exógenas. Dadas las características genéticas de las cepas ETEC aisladas desde granjas industriales de cerdos en Chile, se puede concluir que estas son distintas a las principales cepas asociadas a la enfermedad a nivel mundial.
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    Domestic dog and alien North American mink as reservoirs of infectious diseases in the endangered Southern river otter
    (Universidad Austral de Chile, 2022) Barros, Macarena; Pons, Daniel J.; Moreno, Andrea; Vianna, Juliana; Ramos, Barbara; Dueñas, Fernando; Coccia, Cristina; Saavedra-Rodríguez, Roberto; Santibañez, Alexis; Medina-Vogel, Gonzalo
    Introduced alien carnivores are host to infectious diseases that may become an important threat for native carnivore species conservation. Canine distemper virus (CDV) is thought to be transmitted among individuals by direct contact and to present viral dynamics associated with a density-dependent multi-host carnivore community. In contrast, Canine Parvovirus (CPV) is mostly transmitted by indirect contact and does not depend only on the density, but also on the social behaviour of infected as well as susceptible hosts. The objective of this study was to assess how introduced American mink (Neovison vison) can act as a bridge-host between domestic dog (Canis familiaris) and Southern river otter (Lontra provocax) in different dog and mink population density scenarios. Our data show that otters are seropositive to both CDV and PV, as well as a molecular identity to Parvovirus in dogs and minks. Furthermore, a strong positive correlation between dog population density and observed seroprevalence of CDV in dogs, minks, and otters was recorded. For Parvovirus, the observed seroprevalence in mink and otters was not correlated to a higher dog population density, but instead a relationship between dog and mink population densities and social behaviour. Our results suggest that introduced American mink and domestic dogs are reservoirs of CDV and PV, both being diseases of major importance for the conservation of native endangered carnivores in Patagonia. © 2022 Universidad Austral de Chile. All rights reserved.
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    The frontline : assessment of the skin bacterial communities of three species of rorquals from different environments with human impacts
    (Universidad Andrés Bello, 2019) Toro Cortes, Frederick; Moreno, Andrea
    Efectos de actividades humanas para la salud de los animales, son difícil de cuantificar en la naturaleza, es por esto que el uso de especies centinelas son útiles para entender estos fenómenos, dado ciertas características biológicas de su historia de vida, las hacen sensibles a perturbaciones. Los cetáceos pueden ser un excelente modelo para estudiar el efecto de actividades humanas en ecosistemas puntuales, siendo carnívoros filtradores, su similitud con la fisiología humana e historia de vida. En la última década y gracias al avance de técnicas de secuenciación, es que es sabido que la microbiota juega un rol importante en la mantención de su estado de salud, esto se ha podido extrapolar para especies silvestres, dando a conocer lo relevante que es la microbiota para mantener la salud en especies silvestre. En grandes ballenas se ha descrito la microbiota de la piel, en ballenas jorobadas se describió la presencia de una comunidad microbiano central, en la cual individuos sanos deben tener la presencia de dos géneros Tenacibaculum y Psycrobachter. El objetivo de la presente tesis fue caracterizar la microbiota de la piel de tres especies de rorcuales presentes en tres zonas de alimentación, ballena jorobada (BJ) (M. Novaengliae), ballena azul (BA) (B. musculus) y ballena fin (BF) (B.physalus), presentes en tres sitios de Chile, evaluar el efecto de variables intra-individuales (sexo, clase de edad, parentesco y conducta), entre temporadas en BM (M. novaengliae) y BA (B. musculus) y por último evaluar el efecto del impacto humano en la microbiota de la piel de estas tres especies, además se evaluó la presencia de enfermedades virales (Pox y Herpes virus) en las ballenas y si existe relación entre la presencia de estas enfermedades y la microbiota. Se muestrearon un total 96 individuos de ballenas en tres sitios de Chile, el Estrecho de Magallanes (MS), Chiloé (CHO) y la Reserva Nacional Pingüino de Humboldt (RNPH). Muestras de piel pertenecientes a BJ (n= 60), BA (n=29) y BF (n=9) fueron tomadas. De las BJ del estrecho de Magallanes, se obtuvieron un total de 31 adultos, cuatro juveniles y seis crías, 11 machos y siete hembras, y dos madres con crías para BJ de MS. Para BA de Chiloé se obtuvo un total de 15 adultos y tres juveniles, con cinco hembras, seis machos y dos madres con crías. Se utilizó la secuenciación de la región V4 del gen 16S rRNA, la cual permitió caracterizar la microbiota de la piel de las ballenas, cada taxón de microbioma se clasificó o como variante de secuencia de amplicon (ASV´s). La diversidad de la microbiota de la piel reveló diferencias significativas entre las tres especies de ballenas. La diversidad se estructuró principalmente por las variables especie (10%) y la variable geográfica (13%), y en conjunto explican el 15% de la variabilidad de la microbiota de la piel. Se encontró que la microbiota de la piel de ballenas fue representada por especies de los géneros Cardiobacter, Moraxella, Tenacibaculum, Stenotrophomonas, Flavobacteria y Pseudomonas. También encontramos que, de 1409 linajes detectados en el microbioma, solo 10 ASV´s comprenden el microbioma central entre las tres especies rorcuales, que representaron el 30% de la abundancia total. Solo se observó diferencias en riqueza y abundancia de ASV´s entre la variable sexo en BJ y diferencias entre temporadas. El análisis comparativo de diversidades, encontró diferencias entre temporadas, sexo y edad, esto podría estar explicadas por las conductas diferenciales que presentan tanto machos con hembras como en diferentes edades. Además, se observaron ASV’s de bacterias con abundancias diferenciales en 32 ASV´s para crías, 12 para juveniles en BA y tres ASV´s para crías, cuatro ASV´s para juveniles de BJ, lo cual podría indicar cierta colonización de bacterias en etapas tempranas de la vida de las ballenas, la cual se focaliza en su estado adulto. Se evaluaron 18 variables para impacto humano con efectos directos e indirectos en cetáceos. Cuatro de estas variables explican el 18% de la variabilidad de la microbiota de la piel. Además, se realizó un modelo (GLM) para comprobar si existe alguna relación entre las variables antrópicas y la diversidad, se comprobó si la presencia y/o diferentes abundancias de los géneros Tenacibaculum y Psycrobacter diferenciales influía por zona y la detección de patógenos virales se asocia a sitios con más impacto humano. Nuestros resultados demuestran que tanto RNPH como CHO son las zonas con mayor impacto humano en especial para las variables embarcaciones. Se detectaron dos individuos de BJ de RNPH y MS positivos a HV, ambos ejemplares eran juveniles y presentaban lesiones en la piel. Nuestro modelo representa a RNPH y CHO como las zonas con mayor impacto humano y menor diversidad, además se encontró una asociación entre la ausencia y/o baja abundancia del género Tenacibaculum con la baja diversidad de bacterias en ciertas zonas. Creemos que, de las variables de impacto humano, la variable tráfico de embarcaciones podría producir mayores efectos biológicos en las ballenas, esto se vería reflejado en especial en el género Tenacibaculum, dado que este género presenta funciones inmunológicas sobre la piel de las ballenas. La presente tesis contribuye a comprender las características de la microbiota de la piel de ballenas que visitan Chile, determinar la gran variabilidad de factores que influyen en la composición de esta comunidad bacteriana, demostrando que factores como especie, lugar geográfico, edad, sexo, temporada e impacto humano pueden influir de forma significativa. Es necesario realizar estudios complementarios para profundizar en el entendimiento de cómo variables intra-individuales y ambientales afectan a la microbiota ballenas y en consecuencia la salud de éstas. . La microbiota de la piel de ballenas es una valiosa herramienta como bio-indicador de la salud de ballenas y de los diferentes ecosistemas que habitan, lo cual nos entregará herramientas útiles para el manejo y conservación de las especies y lugares que visitan.