Examinando por Autor "Parra Rojas, Juan Pablo"

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    Análisis del procesamiento del arn mensajero de AtbZIP60 bajo distintos tratamientos que activan la respuesta a la acumulación de proteínas mal plegadas en Arabidopsis thaliana usando electroforesis capilar
    (Universidad Andrés Bello, 2015) Parra Rojas, Juan Pablo; Orellana López, Ariel; Blanco, Francisca; Facultad de Ciencias Biológicas; Escuela de Ingeniería en Biotecnología
    La respuesta a proteínas mal plegada (UPR) es una vía de señalización asociada al retículo endoplásmico (ER). Normalmente, las proteínas sintetizadas en el ER que no logran adquirir su conformación nativa se degradan por un mecanismo denominado degradación asociada a retículo (ERAD). Sin embargo, si este mecanismo falla en degradar proteínas no plegadas / mal plegadas, éstas son retenidas en el ER activando la UPR. Durante este proceso un conjunto de genes que pueden ayudar al plegamiento correcto de las proteínas son regulados positivamente a nivel transcripcional y traduccional. Estudios recientes sobre Arabidopsis thaliana y arroz identificaron una vía de señalización en las cual una proteína transmembrana de ER llamada IRE1 cataliza el empalme citoplasmático y no convencional de un ARN mensajero conduciendo a la síntesis de un factor de transcripción activo capaz de activar los genes de respuesta a UPR. Este factor de transcripción se conoce como bZIP60 en Arabidopsis y bZIP50 en arroz. Informes recientes han mostrado que dos agentes químicos clásicos utilizados para inducir la UPR (tunicamicina y DTT) activan el procesamiento de bZIP60. Sin embargo, la dinámica y la temporalidad del empalme no convencional son desconocidas. Adicionalmente, condiciones fisiológicas en la planta como la acumulación de la fitohormona, ácido salicílico (SA) y estrés por calor; también pueden inducir el procesamiento de bZIP60. En dichas condiciones, bZIP60 procesado, es apenas detectable al utilizar electroforesis en geles de agarosa como instrumento analítico. En esta tesis se propone que el empalme no convencional de bZIP60 podría ser analizado mediante electroforesis capilar, debido a su capacidad de alta resolución y posible cuantificación. Como una prueba de concepto, se analizó la dinámica y temporalidad del procesamiento del gen bZIP60 en las plantas tratadas con tunicamicina, DTT, SA y calor. Los resultados indican que el procesamiento de AtbZIP60 es un proceso dinámico y su ocurrencia y la magnitud es estímulo-dependiente. Además, el procesamiento AtbZIP60 en diferentes tejidos de plantas con o sin estrés, sugiere que la activación del UPR es un proceso tejido específico. Por otra parte, el análisis en plantas mutantes que carecen de otros componentes de la señalización de la UPR, indican que la rama IRE1 / AtbZIP60 no compensa la ausencia de otros componentes tales como bZIP28 bajo condiciones de estrés de ER. En su conjunto los resultados sugieren que el procesamiento de AtbZIP60 es un proceso altamente regulado y que eso no depende únicamente de los estímulos, sino más bien de cómo cada tejido percibe dichos estímulos.