Examinando por Autor "Villanelo Lizana, Felipe"

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    Termodinámica de la unión de Ca2+ a hemicanales de hCx2
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Parra Ahumada, Fabian Alfonso; Villanelo Lizana, Felipe; Facultad de Ciencias de la Vida
    Los canales de unión en hendidura (GJC por sus siglas en inglés: Gap Junction Channel) son canales presentes en eucariontes, formados por dos hemicanales (HCs) o conexones que conectan los citoplasmas de dos células adyacentes. Cada HC se compone de seis proteínas llamadas conexinas (Cx) y pueden estar desacoplados, conectando el citoplasma con el espacio extracelular. Los HC que no forman GJC participan de varios procesos fisiológicos y suelen estar cerrados en condiciones fisiológicas, aunque su apertura puede ser gatillada por cambios en las concentraciones extracelulares de Ca 2+ . No obstante, luego de años de estudios, aún no hay consenso en la comunidad dedicada al tema, sobre el mecanismo mediante el cual los iones calcio regulan la apertura y cierre de los HC, particularmente de HC formados por Cx26, una de las conexinas más estudiadas. La aplicación de protocolos de simulación molecular como complemento a los estudios experimentales han ayudado a estudiar las relaciones estructura-función de estos canales. En este trabajo se realizaron protocolos de modelamiento comparativo de proteínas y simulación molecular para generar las diversas combinaciones posibles de HC-Cx26 unida a calcio, considerando sus 6 monómeros. Con los diferentes modelos planteados y aplicación de la técnica conocida como transformación alquímica, se estudió el efecto termodinámico asociado a la unión de iones calcio. Los resultados indican que no hay una preferencia termodinámica entre las diferentes configuraciones de las mismas cantidades de ion calcio en el sistema, además, indican que el proceso de unión de iones Ca 2+ no presenta propiedades cooperativas en cuanto a la termodinámica asociada y que el sacar iones calcio del sistema es desfavorable energéticamente.