Búsqueda y asignación de riego fenotípico para polimorfismos de sustitución (SNPs) asociados a periodontitis

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dc.contributor.advisorFuentes Zuleta, Patricio
dc.contributor.advisorVidal S., Rodrigo
dc.contributor.authorBenedetto Causa, Andrea
dc.contributor.editorFacultad de Odontología
dc.date.accessioned2020-05-21T20:19:32Z
dc.date.available2020-05-21T20:19:32Z
dc.date.issued2011
dc.descriptionTesis (Magíster en Odontología, Especialización en Periodoncia e Implantología)es
dc.description.abstractLa enfermedad periodontal se manifiesta en respuesta a la infección bacteriana por patógenos específicos que colonizan el área del surco gíngivo-dentario. Es reconocida la etiología multifactorial de la periodontitis, donde factores genéticos y ambientales interactúan para producir la enfermedad y modificar su expresión clínica 3 . Estudios sugieren que habría componentes del genoma que determinarían una variación en el grado de susceptibilidad frente a distintas formas de periodontitis. Una gran variabilidad individual se encuentra en los niveles funcionales de interleuquina 1a, interleuquina 1 í3, factor de necrosis tumoral a y los receptores FCyR lla y FCyR llla de inmunoglobulina G, lo que estaría determinado por la existencia de polimorfismos genéticos, siendo muy comunes entre ellos los polimorfismos de sustitución simple o SNPs. Un SNP es una variante alélica en la secuencia de DNA que se produce cuando un solo nucleótido del genoma está alterado, es decir, corresponde a una mutación puntual. Estas mutaciones pueden encontrarse en cualquier parte del genoma: tanto en regiones codificantes como no codificantes. El presente trabajo busca cuantificar y caracterizar los SNPs de los genes polimórficos de interleuquina 1a, interleuquina 1 í3, factor de necrosis tumoral a y los receptores FCyR lla FCyR llla de inmunoglobulina G y posteriormente clasificar el riesgo fenotípico de cada uno de ellos. Para ello se planteó la hipótesis de que los SNPs de il-1a, il-1í3, TNF-a, FcyRIIA y FcyRIIIA pueden clasificarse de acuerdo al riesgo potencial de originar alteraciones a nivel del fenotipo. En una primera instancia se realizó una búsqueda y selección de genes candidatos asociados a periodontitis basada en la literatura. Luego se realizó una búsqueda y 53 selección de SNPs en los genes candidatos previamente seleccionados. La búsqueda de los SNPs se realizó utilizando la información otorgada por bases de datos de SNPs humanos a las cuales se puede acceder vía Internet. Se clasificaron los SNPs para cada gen candidato de acuerdo a su ubicación en el genoma. Esto derivó en la creación de cinco categorías de SNPs: exónicos, intrónicos, región UTR y vecinos al gen río arriba o río abajo. En el caso de los SNPs exónicos se determinó el efecto esperado. Luego se realizó un ranking de SNPs de acuerdo al riesgo de consecuencia fenotípica. Esta etapa se realizó con la ayuda del programa FastSNP que permite jerarquizar los SNPs de acuerdo a su riesgo a nivel del fenotipo y sus posibles efectos funcionales. Se determinó para el gen de 11 1 a, la existencia de nueve SNPs exónicos. De ellos, uno tiene un riesgo de consecuencia fenotípica "muy alto", cuatro tienen un riesgo "medio alto" y cuatro "medio bajo". En el caso del gen de la 11 1 ~. se encontraron tres SNPs de tipo exónico, todos con riesgo de consecuencia fenotípica "medio bajo". Para el TNFa, se detectaron siete SNPs exónicos, de los cuales sólo pudieron clasificarse dos. Ambos cayeron en la categoría de riesgo "muy bajo". Finalmente, hubo que reunir en una sola categoría a ambos receptores Fcy debido a que los programas no las tienen separadas. Se encontró nueve SNPs exónicos. De ellos, uno se clasificó como riesgo de consecuencia fenotípica "muy alto", seis se clasificaron como riesgo "medio bajo" y dos como riesgo "muy bajo". A futuro, importante sería desarrollar una metodología precisa y completa que pudiera utilizarse como apoyo en la selección de este tipo de marcadores. De esta forma, podría posteriormente asignarse a los individuos un valor de riesgo potencial de desarrollar una patología como la periodontitis de acuerdo a la variante génica que ellos 54 porten y así enfocarse de manera apropiada en las medidas preventivas que correspondan según cada caso.es
dc.identifier.urihttp://repositorio.unab.cl/xmlui/handle/ria/13598
dc.language.isoeses
dc.publisherUniversidad Andrés Belloes
dc.subjectEnfermedades periodontaleses
dc.titleBúsqueda y asignación de riego fenotípico para polimorfismos de sustitución (SNPs) asociados a periodontitises
dc.typeTesises
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