Examinando por Autor "Antiqueo Aravena, Paulette Valesca"

Mostrando 1 - 1 de 1
  • Miniatura
    Ítem
    Caracterización del transcriptoma del erizo chileno (Loxechinus albus) utilizando secuenciación masiva
    (Universidad Andrés Bello, 2017) Antiqueo Aravena, Paulette Valesca; Valdés, Juan Antonio; Meneses, Claudio; Facultad de Ciencias Biológicas; Escuela de Ingeniería en Biotecnología
    Chile es uno de los principales exportadores de gónadas de erizo en el mundo. Sin embargo, este recurso ha sido sobreexplotado en los últimos años producto del incremento en sus tasas de captura. El erizo chileno (Loxechinus albus), se distribuye a lo largo del litoral de todo el país, posee un lento crecimiento y se alimenta principalmente de algas. Este organismo no posee dimorfismo sexual externo y su forma de reproducción es exclusivamente sexual a través de fecundación externa. El erizo chileno tiene su mitogenoma secuenciado, con lo cual se estableció la relación filogenética con otros equinodermos, grupo que es ampliamente estudiado debido a su relación filogenética con los cordados. Complementariamente se encuentra disponible el genoma secuenciado del erizo modelo Strongylocentrotus purpuratus, en donde se puede observar la gran similitud de genes con los vertebrados, destacando un sofisticado sistema inmune innato, siendo los celomocitos las células con capacidades fagociticas que comandan su respuesta inmune. La información génica y genómica disponible sobre L. albus es muy escasa, encontrándose solo las secuencias pertenecientes a los estudios del mitogenoma y microsatélites. Con el objetivo de “Caracterizar el transcriptoma de celomocitos, intestino y gónada del erizo chileno”, se realizó la secuenciación del ARN de estos tres tejidos. Las lecturas resultantes fueron filtradas con Flexbar y ensambladas con Trinity, encontrando alrededor de ciento ochenta mil contigs, de los cuales fueron anotados el 31% de estos con la herramienta Blast. Adicionalmente, se realizó una segunda anotación utilizando redes de similitud de secuencia, logrando anotar un 75% de los unigenes. Con los resultados obtenidos a partir de la anotación y usando la herramienta DAVID, fue posible determinar los términos ontológicos asociados a cada uno de los tejidos, destacando en celomocitos e intestino su rol en el sistema inmune del erizo. Por otra parte, el intestino cumpliría un rol clave en la homeostasis general de este organismo, y se encontró que las gónadas serían un órgano con un comportamiento dual, relacionado a reproducción y almacenamiento de nutrientes. Este trabajo sirve de base para la realización de futuros estudios en esta especie, no solo para conocer la biología básica de este organismo, sino que también asociado a la producción de este recurso pesquero.