Identificación de ARN no codificantes pequeños (sARN) que regulan el desarrollo del fruto en Prunus persica [L.] Batsch

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dc.contributor.advisorMeneses, Claudio
dc.contributor.advisorSáez Aguayo, Susana
dc.contributor.authorTorrejón Madariaga, Valentina Paz
dc.contributor.editorFacultad de Ciencias de la Vida
dc.date.accessioned2025-03-08T21:50:43Z
dc.date.available2025-03-08T21:50:43Z
dc.date.issued2024
dc.descriptionTesis (Magíster en Biotecnología y Ciencias de la Vida)
dc.description.abstractPrunus persica (P. persica) es un árbol frutal perteneciente a la familia de las Rosaceae. Los frutos tienen características organolépticas y nutricionales generando alta demanda. Por su parte, Chile se encuentra en el primer lugar de Sudamérica y cuarto a nivel mundial en exportación de duraznos y nectarines (P. persica). Dado que estos frutos tienen importancia económica y social, es de interés generar nuevas variedades que satisfagan las necesidades agronómicas y comerciales de la industria. P. persica es considerado un organismo modelo por poseer un genoma diploide y pequeño (265 Mpb), distribuido en 8 cromosomas. Además, su genoma está secuenciado y disponible. Los frutos presentan cualidades climatéricas reflejadas en el rápido ablandamiento del fruto luego de ser cosechado. El desarrollo del fruto se caracteriza por presentar 4 etapas representadas en una curva doble sigmoidea (S1, S2, S3, S4). Por esto, se determina un momento de madurez fisiológica y una fecha de cosecha (MD; del inglés “Maturity Date”) para cada variedad. Por su parte, el proceso de desarrollo del fruto es regulado por varias fitohormonas (ácido jasmónico, etileno, giberelinas, citoquininas) y en particular, el ácido jasmónico participa activando vías relacionadas con la pérdida de firmeza de la pulpa por el desensamblaje de la pared celular y en el endurecimiento del carozo. Las secuencias no codificantes de ARN (ncARN) no son capaces de traducirse a proteínas, pero si influyen en la expresión de genes. Dentro de los ncARN, se encuentran los microARN (miARN), ARN de interferencia (siARN), ARN asociado a Piwi (piARN) y ARN no codificante de cadena larga (lncARN). A su vez los miARN y siARN presentan secuencias cortas con 21-26 pb. Por esta razón, se consideran como ARN no codificantes pequeños (sARN). Además, se ha descrito que miARN y siARN presentan funciones regulatorias a nivel post-transcripcional. Las plantas presentan microARN, éste comprende una vía de biogénesis que forma un complejo de silenciamiento inducido por miARN maduro (miRISC). El Laboratorio de Agrogenómica (PUC) realizó un análisis bioinformático previo enfocado en las interacciones entre vías hormonales y epigenéticas (metiloma) durante el desarrollo del fruto, seleccionando genes candidatos relacionados con las rutas de biosíntesis de ácido jasmónico involucrados en el desarrollo del fruto. Considerando todo lo anterior, la hipótesis propuesta es: MicroARNs contribuyen en la regulación de genes involucrados en rutas metabólicas de ácido jasmónico durante el desarrollo del fruto en Prunus persica, explicando las diferencias entre variedades contrastantes para fecha de cosecha. Así, el objetivo general es identificar microARN que regulan el proceso de desarrollo y maduración de fruto en variedades contrastantes para fecha de cosecha en P. persica. En primera instancia, la estrategia experimental consiste en un análisis bioinformático para identificar microARNs expresados diferencialmente en variedades contrastantes (‘Early Juan’ y ‘Super August’) para fecha de cosecha en P. persica. Luego, se analizará la co-expresión entre microARN y mARN expresados diferencialmente durante desarrollo de fruto para las mismas variedades. Finalmente, validamos los genes candidatos mediante técnicas de RT-qPCR.
dc.identifier.urihttps://repositorio.unab.cl/handle/ria/63700
dc.language.isoes
dc.publisherUniversidad Andrés Bello
dc.subjectDuraznos
dc.subjectGenética
dc.subjectHormonas Vegetales
dc.titleIdentificación de ARN no codificantes pequeños (sARN) que regulan el desarrollo del fruto en Prunus persica [L.] Batsch
dc.typeTesis
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