Identificación de variedades de arándano (Vaccinium spp.) empleando la técnica de análisis de fusión de alta densidad HRM con tres marcadores moleculares

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dc.contributor.advisorAvila Olmos, Alexis
dc.contributor.advisorMoreno Vilches, Adrián Andrés
dc.contributor.authorAraya Castro, Sebastián Gabriel
dc.contributor.editorFacultad de Ciencias de la Vida
dc.date.accessioned2024-08-13T15:48:12Z
dc.date.available2024-08-13T15:48:12Z
dc.date.issued2023
dc.descriptionMemoria de título (Ingeniero en Biotecnología)
dc.description.abstractBella, Mágica y Bonita son algunas de las variedades de arándano (Vaccinium spp.) de un alto interés comercial. Por lo que es indispensable su correcta identificación en etapas tempranas produciendo dificultades por su fuerte similitud morfológica y su estrecha relación entre ellas. Es por esto que la implementación de técnicas basadas en secuenciación de DNA son de un gran interés pero conlleva un alto gasto económico y de tiempo, Es por eso que se plantea implementar una técnica novedosa llamada fusión de alta resolución de PCR cuantitativa (qPCR-HRM) con el objetivo de acortar los tiempos de respuesta y gastos asociados a la identificación de variedades vegetales de Arándano. Los resultados con la técnica de qPCR-HRM se basa en interpretación de los perfiles de fusión para cada variedad de Arándano empleando marcadores moleculares polimórficos de tipo SSR o comúnmente llamados microsatélites para la discriminación de Vaccinium spp. Se trabajó con 11 variedades de Arándano estrechamente relacionadas, esto implica una alta similitud de los alelos entre las variedades siendo un proceso largo el análisis de datos para la técnicas actuales de identificación como electroforesis capilar. Dentro de los resultados de qPCR=HRM el comportamiento de los perfiles o curvas de fusión fue muy diferenciador donde se logra distinguir claramente unos perfiles de fusión de otros esto proporcionó información valiosa para la interpretación y análisis de datos integral logrando así una mayor resolución de los resultados, las curvas de fusión para las 11 variedades de arándano fueron distintivas pudiendo discriminar entre todos los perfiles de fusión.
dc.description.abstractBella, Magic and Bonita are some of the blueberry varieties (Vaccinium spp.) of high commercial interest. Therefore, their correct identification in early stages is essential, causing difficulties due to their strong morphological similarity and their close relationship between them. This is why the implementation of techniques based on DNA sequencing is of great interest but entails high financial and time expenditure. This is why it is proposed to implement a novel technique called high-resolution fusion of quantitative PCR (qPCR-HRM). with the aim of shortening response times and expenses associated with the identification of Blueberry plant varieties. The results with the qPCR-HRM technique are based on the interpretation of the fusion profiles for each Blueberry variety using polymorphic molecular markers of the SSR type or commonly called microsatellites for the discrimination of Vaccinium spp. We worked with 11 closely related Blueberry varieties, this implies a high similarity of the alleles between the varieties, making the data analysis for current identification techniques such as capillary electrophoresis a long process. Within the qPCR=HRM results, the behavior of the melting profiles or curves was very differentiating where it was possible to clearly distinguish some melting profiles from others, this provided valuable information for the interpretation and analysis of comprehensive data, thus achieving greater resolution of the results. Results, the melting curves for the 11 blueberry varieties were distinctive and could discriminate between all melting profiles.
dc.identifier.urihttps://repositorio.unab.cl/handle/ria/59213
dc.language.isoes
dc.publisherUniversidad Andrés Bello
dc.subjectArándanos
dc.subjectIdentificación
dc.subjectFusión de Alta Resolución
dc.titleIdentificación de variedades de arándano (Vaccinium spp.) empleando la técnica de análisis de fusión de alta densidad HRM con tres marcadores moleculares
dc.typeTesis
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