Fac.CV - Trabajos de Titulación Pre-Grado

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    Relación entre pseudomonas spp. resistentes a antibióticos presentes en aguas superficiales de los ríos Maipo y Mapocho y las variables ambientales: temperatura y ph
    (Universidad Andrés Bello, 2024) Zenteno Albornoz, Ignacio Benjamín; Adell Nakashima, Aiko.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    Las bacterias del género Pseudomonas son conocidas por su versatilidad y capacidad de adaptación a diversos nichos ecológicos. Por un lado, las especies clínicas han sido ampliamente estudiadas, mientras que las especies de bajo interés clínico han recibido menos atención, a pesar de su potencial como reservorios de resistencia antimicrobiana en el medio ambiente. Este estudio tuvo como objetivo evaluar la relación entre la presencia de Pseudomonas resistentes no clínicas y las variables ambientales de pH y temperatura en las aguas superficiales de los ríos Maipo y Mapocho en Chile. Se recolectaron muestras de agua en puntos específicos de ambos ríos, registrando características ambientales como el pH y la temperatura. Las muestras se analizaron mediante técnicas de cultivo y MALDI-TOF para la identificación de Pseudomonas, en conjunto a antibiogramas utilizando el método de difusión en disco para determinar los perfiles de resistencia. Se aplicaron análisis estadísticos para evaluar la asociación entre las variables ambientales y la presencia de Pseudomonas resistentes. Los resultados no mostraron una asociación significativa entre el pH y la temperatura con la detección de perfiles de multi resistencia a antibióticos. Sin embargo, se identificaron rangos específicos de estas variables que favorecen una mayor detección de Pseudomonas spp. Los aislados presentaron una mayor resistencia al antibiótico aztreonam con un 42% del total de aislados, seguido por ceftazidima con un 20% y en menor medida cefepime y ciprofloxacina. La principal limitación del estudio fue el tamaño muestral reducido, lo que aumenta el error estadístico. Este trabajo proporciona información sobre la ecología de Pseudomonas resistentes no clínicas en aguas superficiales, destacando la importancia de considerar factores ambientales en la vigilancia de la resistencia antimicrobiana en ecosistemas acuáticos
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    Influencia de las condiciones climáticas de origen sobre la respuesta defensiva de Arabidopsis thaliana contra Myzus persicae y Brevycorine brassicae
    (Universidad Andrés Bello, 2024) Zambrano Jiménez, Sebastián Ignacio.; Blanco Herrera, María Francisca; Delgado Rioseco, Joaquín.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    El cambio climático constituye uno de los principales desafíos adaptativos para las plantas. Estos organismos sésiles han desarrollado diversos mecanismos para enfrentar diferentes tipos de estrés ambiental, tanto bióticos como abióticos. En este contexto, se han planteado varías hipótesis de que el clima podría influir en la respuesta defensiva de las plantas. Por lo tanto, esta investigación evaluó cómo la producción constitutiva e inducida de compuestos fenólicos en respuesta al estrés biótico, causado por áfidos tanto un áfido generalista como un especialista con un gran impacto agrícola (Myzus persicae y Brevicoryne brassicae) se relaciona con el grado de aridez de origen de 9 ecotipos de Arabidopsis thaliana. Los resultados revelaron hallazgos inesperados. Se observó una compensación entre las defensas constitutivas e inducidas de flavonoides y antocianinas en los ecotipos de A. thaliana expuestos a M. persicae, comportamiento que no se evidenció con B. brassicae, el cual mostró una compensación sólo a las 6 horas. La inducción de defensas provocada por ambos áfidos no mostró una correlación con el grado de aridez de los 9 ecotipos estudiados. Curiosamente, se detectó una inducción defensiva temprana a las 6 horas en respuesta a B. brassicae, pero además este mismo áfido exhibió un comportamiento supresivo de defensas pronunciado en antocianinas a las 6 horas, mientras que M. persicae presentó un comportamiento represivo temprano de flavonoides. Estos hallazgos sugieren que la producción de compuestos fenólicos defensivos frente a la herbivoría por áfidos está influenciada por factores adicionales más allá de la aridez climática.
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    Diseño computacional de un péptido interferente para el complejo de elongación, replicación y transcripción de SARS-CoV-2
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Villegas Sánchez, Camila Valeria Francisca.; Márquez Miranda, Valeria.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    El año 2020 inició una pandemia a causa del virus SARS-CoV-2, el cual se replica en las células huésped gracias a su complejo de elongación, replicación y transcripción (Nsp7/Nsp8/Nsp12). Actualmente, existen muchos fármacos que han sido desarrollados in sílico (como naringenina) y otros que han llegado a las pruebas in vitro (sofosbuvir (SOF)) dando resultados positivos a la hora de inhibir RNA polimerasa RNA dependiente (RdRp o Nsp12). Si bien ha habido avances en el tema, los fármacos en estudio podrían resultar no ser tan eficientes cuando existen mutaciones del virus, esto es debido a que tanto medicamentos como vacunas se enfocan principalmente en la proteína Spike (propensa a mutaciones) o presentar alta toxicidad. Con el fin de disminuir la actividad viral y el problema de las mutaciones, se propone, mediante el uso de herramientas computacionales como docking molecular, simulación MD y el método MM/GBSA, diseñar péptidos interferentes que se unan a sectores altamente conservados de Nsp12, los cuales serán obtenidos a partir de sitios de interacción con Nsp8 y se utilizará dicho fragmento nativo como referente para realizar mutaciones y optimizaciones con el fin de obtener un PI que tenga mejor afinidad por la proteína no estructural Nsp12. A partir del trabajo realizado se obtuvo dos fragmentos nativos de Nsp8 con 13 y 15 aminoácidos cada uno, en base a estos dos péptidos se realizaron mutaciones, las cuales generaron dos mutantes 13 MUT1 y 13 MUT2 que fueron prometedoras, especialmente 13 MUT2, la cual mediante las distintas herramientas computacionales resultó tener un ΔG total más negativo, es decir, muestra mayor afinidad que el fragmento peptídico nativo obtenido a partir de Nsp8. Esta tesis abre la posibilidad de continuar con esta investigación, mutando fragmentos de Nsp8 con el fin de lograr el mejor péptido interferente posible para el complejo de elongación, replicación y transcripción de SARS-CoV-2 y así generar una alternativa terapéutica efectiva para evitar una nueva pandemia a partir de algún virus de la familia Coronaviridae.
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    Efecto de los glucocorticoides durante estrés crónico como modelo de depresión, asociado a un aumento de la actividad de hemicanales de Cx43 astrogliales
    (Universidad Andrés Bello, 2024) Flores Aguayo, Carolina Elena; Stehberg Liberman, Jimmy; Facultad de Ciencias de la Vida
    La depresión afecta a un 10% de la población Mundial y desempeña un papel clave en el riesgo de suicidio. A pesar de que la etiología de la depresión no se comprende completamente, se ha propuesto que el glutamato, el principal neurotransmisor excitatorio del cerebro, cumple un rol crítico en la fisiopatología de la depresión. Niveles elevados de glutamato en regiones cerebrales asociadas a la motivación, como el hipocampo ventral, se han vinculado con la aparición de síntomas depresivos. Aunque las neuronas son conocidas como la fuente principal del glutamato sináptico, los astrocitos también lo liberan hacia las sinapsis, por medio principalmente de los hemicanales de conexina 43 (Cx43), especialmente bajo condiciones de estrés, el cual es un factor de riesgo clave para la depresión. En respuesta al estrés crónico, los hemicanales de Cx43 aumentan su actividad, resultando en la liberación aumentada de glutamato en el hipocampo ventral. Paralelamente, el estrés activa la liberación de glucocorticoides, hormonas que poseen un rol clave en la depresión. El mecanismo por el cual los glucocorticoides afectan la actividad de hemicanales de Cx43 y la liberación de glutamato astroglial se desconoce. Resultados preliminares de nuestro laboratorio indican que la disminución abrupta de los glucocorticoides después del estrés crónico es el evento que desencadena la aparición de síntomas tipo depresivos en ratas. Por ello, propusimos como hipótesis que la caída de glucocorticoides tras el estrés crónico causa un aumento de la liberación de glutamato mediada por hemicanales de conexina 43 astrogliales, ocasionando síntomas tipo-depresivos. Para poner a prueba esta hipótesis, se sometieron ratas macho a estrés crónico por restricción de movimiento durante dos horas por 10 días para inducir síntomas tipo-depresivos y se usó la prueba de cola (TST) para evaluar los síntomas tipo-depresivos. Una combinación de bloqueos farmacológicos de hemicanales de Cx43 con TAT-Cx43L2, y la administración de corticosterona en forma intravenosa, intra-hipocampal y subcutánea se utilizó para determinar el rol de glucocorticoides post-estrés en la actividad de hemicanales de Cx43 astrogliales y glutamato extracelular en el hipocampo ventral y en el desarrollo de síntomas tipo-depresivos. Los resultados muestran que la disminución de glucocorticoides induce la activación de los hemicanales de Cx43, desencadenando la liberación de glutamato y la aparición de síntomas tipo-depresivos en ratas.
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    Efecto de la inhibición de la vía de señalización de IL-1 en el fenotipo secretor de fibroblastos orales senescente
    (Universidad Andrés Bello, 2024) Morales Gómez, Dannae Ignacia; Aránguiz Urroz, Pablo; Niklander E., Sven; Facultad de Ciencias de la Vida
    El cáncer es una de las patologías principales que ha impulsado el desarrollo de nuevas investigaciones que permitan avanzar a nivel molecular para desarrollar nuevas técnicas y estrategias terapéuticas. Por otro lado, la senescencia corresponde al envejecimiento celular que está caracterizado por una detención irreversible del ciclo celular, las células senescen y se encuentran activas metabólicamente y desarrollan un fenotipo secretor el cual también es conocido como fenotipo secretor asociado a senescencia o SASP, por sus siglas en inglés. IL-1 se considera como la citocina principal iniciadora del SASP y la inhibición de esta vía ha sido propuesta como una alternativa para la modulación de este, ya que IL-1α vía IL-1R activa a NF-kB, generando como respuesta la secreción de IL-6 (entre otras), la cual se ha asociado a la promoción y progresión tumoral. OBJETIVO: Evaluar el efecto de la inhibición de la vía de señalización de IL-1 en fibroblastos orales senescentes normales (FOSN) para la determinación y caracterización del fenotipo secretor asociado a senescencia (SASP). MÉTODOS: Fibroblastos orales normales (FON) aislados de humanos, fueron cultivados y estimulados con peróxido de hidrógeno (H2O2) para la evaluación y detección de senescencia mediante el kit X-gal. Los genes y proteínas del SASP fueron determinados mediante western blot, RT-qPCR y con Kit de matriz de citocinas Proteome Profiler Human XL. RESULTADOS: Se logró evidenciar que las células estaban senescentes y el ensayo de proliferación entregó que si se generaba una inhibición de este proceso en las células con X-gal positivo. Además, se presentó un aumento significativo en los niveles de la expresión de IL-6 en los fibroblastos al ser estimulados con H2O2 en comparación a los que no fueron, y también se logró ver una disminución en la expresión de IL-6 al incubar las células con el inhibidor IL-1Ra. CONCLUSIÓN: la senescencia fue inducida con éxito en FON con H2O2, verificando el fenotipo senescente en FON, obteniendo un alto porcentaje en células positivas para X-gal; además, se confirmó la presencia de p16 en células senescentes y un aumento significativo en la expresión de IL-6. Por lo que al realizar la evaluación del secretoma con y sin inhibidor de IL-1, se espera poder utilizar este en diversos tratamientos de algunas enfermedades como por ejemplo el cáncer.
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    Estudios de los factores sigma involucrados en la respuesta a estrés osmótico en aislados de Salmonella que permanecen en la línea de producción de una granja de pollos de la Región Metropolitana
    (Universidad Andrés Bello, 2024) Salinas Barrera, Valentina Ignacia; Saavedra, Claudia; Facultad de Ciencias de la Vida
    Salmonella es un patógeno bacteriano intracelular facultativo, perteneciente a la familia Enterobacteriaceae. Se divide en dos familias: Salmonella enterica (S. enterica) y Salmonella bongori (S. bongori). S. enterica posee más de 2600 serovares caracterizados y es uno de los patógenos más relevantes en el área de investigación debido principalmente a su impacto en la salud de la población. Estas bacterias han desarrollado diversos mecanismos para adaptarse a condiciones de estrés. Dentro de estos mecanismos descritos se encuentra la adaptación a estrés ácido, estrés oxidativo y estrés osmótico, siendo los mecanismos de modulación génica, la principal estrategia de supervivencia. Estos sistemas de regulación molecular le permiten a Salmonella adaptarse a diversos ambientes y regular la expresión de determinados metabolitos para enfrentar condiciones adversas dentro y fuera del hospedero. Uno de los componentes más importantes en la respuesta génica de Salmonella son los denominados Factores Sigmas, que corresponden a proteínas con funciones reguladoras, y controlan numerosas funciones esenciales en bacterias, siendo la más importante, la eficiente y oportuna transcripción de genes de respuesta. En Salmonella se han descrito distintas familias de Factores Sigma (σ), como σE (σ24), σF (σ28), σH (σ32), σS (σ38) y σN (σ54), que participarían en la adaptación a diferentes tipos de estrés del tipo ácido, oxidativo y osmótico. En la problemática actual, uno de los focos de interés es la creciente prevalencia de Salmonella enterica serovar Infantis (S. Infantis) en granjas y criaderos de pollos, lo que provoca contaminación en líneas de producción avícola. La persistencia de este género en dichos procesos productivos, puede generarse debido al desarrollo de resistencia a determinados antibióticos y desinfectantes utilizados en la industria para combatir infecciones generadas en las diferentes etapas de la industria. Investigaciones recientes han identificado que se han desarrollado modelos basados en aprendizaje automatizado para la identificación de procesos implicados en resistencia patógena. Por otra parte, también se sabe que en modelos de estudio como Escherichia coli y Staphylococcus aureus se producen sustituciones aminoacídicas que alteran el rendimiento de la RNA polimerasa (RNAP), y como consecuencia la tasa transcripcional, afectando directamente la respuesta a tóxicos y condiciones adversas del entorno, convirtiéndolas en cepas más resistentes. A partir de estos antecedentes, la hipótesis planteada es que el desarrollo de un modelo bioinformático basado en aprendizaje automatizado permite la identificación de sitios promotores que son reconocidos por los Factores Sigma en respuesta al estrés osmótico, lo que contribuye a su permanencia en la línea de producción, en cepas de Salmonella Infantis aisladas de la granja avícola, de la RM. Para desarrollar este trabajo se realizó una investigación bioinformática que permita la obtención de un modelo que nos facilite la exploración de las secuencias promotoras de genes de respuesta a estrés osmótico presentes en S. Infantis, e identificar las posibles modificaciones en los motivos de unión. Para llevar a cabo esto, se utilizaron las secuencias de los genomas de aislados de S. Infantis de la línea de producción de una industria avícola de la RM, para posteriormente identificar los Factores Sigma presentes y la distribución que posean en su genoma. También se analizaron los genes involucrados en la respuesta a la resistencia osmótica, y a otros estreses, para tratar de identificar secuencias genómicas como motivos transcripcionales, operones, promotores y sus respectivos sitios de inicio de la transcripción. En particular se identificó la distribución de los factores sigmas codificados en los genes rpoE, rpoD, rpoH, rpoN, rpoS y fliA que responden al estrés osmótico de las cepas de S. Infantis SE016 y SE081. Se espera que esta información conduzca a la identificación precisa del sitio de inicio de la transcripción (+1) y sus promotores asociados. En una fase posterior de la investigación, se pretende identificar las secuencias específicas que nos permitan detectar las sustituciones nucleotídicas (SNPs) presentes en los promotores identificados de las cepas mencionadas. A partir de esta búsqueda, se obtuvo que los Factores Sigma presentan distancias filogenéticas estrechas entre los serovares de Salmonella, por lo tanto, se propuso enfocar el estudio solo en las regiones promotoras. El resultado obtenido fue la identificación de 4695 genes, y 903 operones pertenecientes a estos, identificados bajo la plataforma Operon Mapper, lo cual dio paso al escaneo del genoma y la posterior identificación de las cajas transcripcionales -10 y -35 perteneciente a cada gen regulado bajo el Factor Sigma S en estrés osmótico, en las cepas SE016 y SE081 de S. Infantis. En los ensayos realizados, se obtuvo que los genes adiA, ompW, cpxR, rpoS y osmB que responden frente a estrés osmótico se encuentran presentes en las cepas SE016 y SE081 pertenecientes a S. Infantis, en donde el gen rpoS logró ser insertado en un vector de clonamiento y su posterior inserción en cepas de E. coli, lo cual permitiría en ensayos futuros el análisis de expresión de los sitios promotores pertenecientes a los genes adiA, ompW, cpxR, y osmB, en conjunto con rpoS frente a estrés osmótico.
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    Comparación de la estructura comunitaria aviar entre zonas con luminaria led y luminaria tradicional en Montevideo, Uruguay
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Vásquez Pinto, Vicente Ismael.; Quirici Valadán, Rosina Verónica.; Facultad Ciencias de la Vida.
    La creciente urbanización, impulsada por el aumento global de la población, se presenta como un fenómeno acelerado que invade áreas periféricas debido al incremento de la densidad poblacional. Los entornos urbanos generan diversos factores estresantes ambientales, como contaminación química, acústica, lumínica, dietas de menor calidad y enfermedades emergentes. La contaminación lumínica nocturna, conocida como ALAN, ha aumentado significativamente en regiones urbanizadas como Europa, Norteamérica, Asia y el este de Sudamérica. La exposición a la luz artificial afecta el ciclo circadiano de las aves, regulando funciones fisiológicas clave, como la reproducción, y la actividad nocturna. A pesar del aumento de estudios sobre los efectos individuales de la luminaria en aves, hay escasa investigación sobre su impacto en comunidades, y éstas se han realizado en especies migratorias y ninguna de ellas en Sudamérica. En esta tesis se comparó la comunidad de aves (riqueza, diversidad, equitatividad y similitud comunitaria) entre sitios con luz de sodio y luminaria LED (5000K) en 4 zonas de la ciudad de Montevideo, Uruguay durante las 4 estaciones del año. Se hipotetizó que dado que la luz LED fría (5000 K) modificar el ritmo circadiano y modificar el metabolismo, provocaría una disminución de la riqueza de especies, diversidad y equitatividad en zonas con luminaria LED fría en comparación a luminaria de sodio, generando comunidades disímiles. Se utilizó un ANOVA de medidas repetidas con la Zona y al tipo de luminaria como efecto fijo y el mes como medida repetida (el mismo punto fue muestreado en 4 meses diferentes). Contrario a lo esperado, se observó que no hubo diferencias en la mayoría de los índices entre luminarias de Sodio y LED, a excepción de la riqueza, en donde se observó una interacción significativa entre la zona y el tipo de luminaria (menor en puntos LED). Como recomendaciones para siguientes investigaciones se propone continuar con el muestreo dado que este estudio de corta duración (1 año) y la falta de efecto puede deberse a que no ha pasado el tiempo suficiente para detectar un efecto de ALAN en comunidades y menos aún a nivel evolutivo.
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    Evaluando potenciales impactos ecológicos del geco introducido en Chile, Tarentola mauritanica
    (Universidad Andrés Bello, 2024) Valdivia Villagra, Juan Antonio.; Reyes Olivares, Claudio Vittorio.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    El geco mediterráneo, Tarentola mauritanica, es una especie exótica introducida en Chile de la cual se desconoce si podría afectar negativamente a especies nativas a través de mecanismos ecológicos como la competencia o la depredación. En el presente trabajo, se evaluó: 1) si existe solapamiento en el uso de hábitat (nicho espacial) y en la actividad diaria (nicho temporal) entre T. mauritanica y una lagartija nativa simpátrica, Liolaemus tenuis, y 2) la dieta (nicho trófico) del invasor, en un ambiente urbano, la ex Ciudad del Niño, Región Metropolitana. En la primavera de 2023, y durante dos semanas, se registró el uso de sustrato (construcción, muro perimetral, madera, pastizal y suelo desnudo) y la hora de actividad de los saurios, y se analizó el contenido estomacal extraído desde 30 gecos a través del método de succión gástrica. La amplitud de nicho del uso de hábitat fue mayor en L. tenuis que en T. mauritanica; sin embargo, ambas especies presentaron una alta superposición en el nicho espacial, cohabitando en distintos hábitats, principalmente en el de construcción. Tarentola mauritanica presentó actividad catemeral, con un nicho temporal de actividad diaria más amplio que el de L. tenuis; ambas especies superpusieron sus rangos de actividad entre las 12:00-18:00 h. Por otro lado, La dieta de T. mauritanica se caracterizó por estar compuesta principalmente por artrópodos, especialmente lepidópteros de gran tamaño relativo. La similitud en el uso de recursos entre estos lagartos puede derivar en una potencial competencia por los recursos de su medio ambiente; asimismo, su interacción a nivel espacial y temporal podría aumentar las probabilidades de que la especie nativa sea contagiada con parásitos y/o enfermedades, o vea desplazado su nicho. Además, los hábitos alimenticios del geco podrían contribuir a la declinación de la entomofauna nativa. Estos resultados convierten a T. mauritanica en una posible amenaza, por lo menos, para la herpeto- y entomofauna nativa de Chile.
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    Estudio de la dieta de la nutria marina (Lontra felina) y visón americano (Neogale vison) en la costa valdiviana
    (Universidad Andrés Bello, 2024) Solari Romkema, Camilla Antonia; Medina-Vogel, Gonzalo; Calvo Mac, Carlos Luis Gabriel.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    La introducción de especies invasoras amenaza la biodiversidad global afectando principalmente los ecosistemas sensibles, como son las zonas costeras. En Chile, el visón americano (Neogale vison) desafía la conservación de especies nativas como la nutria marina (Lontra felina). Este estudio evaluó la potencial superposición de dietas entre estas especies en la costa de Valdivia. Se recolectaron muestras de heces y vibrisas de L. felina y N. vison en Calfuco y Pilolcura, Valdivia. Las heces se analizaron para identificar restos de presas, y las vibrisas se sometieron a análisis de isótopos estables de carbono y nitrógeno. Se utilizaron el índice de Renkonen y el análisis de SIBER para evaluar la superposición de dietas. El análisis de heces mostró que ambas especies se alimentan principalmente de crustáceos y peces, con N. vison incluyendo también aves. El análisis de isótopos reveló diferencias sutiles entre sexos en L. felina, con las hembras presentando una dieta más especializada. Contrario a lo esperado, no se encontró una superposición significativa entre las dietas de L. felina y N. vison. La firma isotópica de N. vison resultó más amplia, con valores de δ13C más negativos y δ15N más altos. Las diferencias en los patrones alimentarios de L. felina entre Calfuco y Pilolcura sugieren una influencia de factores locales en las estrategias de forrajeo. La ausencia de superposición significativa con N. vison podría indicar una partición de recursos o el uso de fuentes de alimento diferentes. Se necesita más investigación para comprender completamente estas interacciones y sus implicaciones para la conservación de L. felina. El tamaño limitado de la muestra plantea desafíos para la interpretación de los resultados. Este estudio proporciona nuevos conocimientos sobre las interacciones alimentarias entre una especie nativa amenazada y una especie invasora en ecosistemas costeros chilenos.
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    Evaluación del potencial antagonista de bacterias intestinales de salmónidos frente al crecimiento de Piscirickettsia salmonis en células rtgutgc
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Rubio Espinoza, Meraiot Jerusalén.; Tello Reyes, Mario César; Parra Mardónez, Mick Philippe.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    La piscirickettsiosis es la principal enfermedad que causa muertes en trucha arcoíris y en salmón del Atlántico, afectando fuertemente la industria acuícola chilena. Esta enfermedad es ocasionada por la bacteria Piscirickettsia salmonis, la cual tiene la capacidad de infectar, replicar y sobrevivir en células del sistema inmune como son los macrófagos, presentando así la característica de ser intracelular facultativa. Para el control de esta enfermedad, actualmente se utilizan vacunas y antibióticos. Las vacunas, a pesar de su aplicación durante varios años no han podido controlar efectivamente esta enfermedad. Los antibióticos, aunque efectivos, pueden ser dañinos para el medio ambiente. A raíz de esto, se han buscado nuevas formas de controlar la enfermedad, como el uso de probióticos, los cuales han mostrado mejorar la salud y/o la respuesta inmune del individuo, mediante la interacción con las células inmunitarias, como los macrófagos. El uso de probióticos alóctonos (bacterias aisladas desde una fuente distinta a quien recibe el probiótico) puede generar lesiones en el intestino o disbiosis. Por otro lado, utilizar probióticos autóctonos (bacterias aisladas del mismo individuo) resulta en un mejor desempeño de estos, debido a que se enfrentan a un ambiente ya conocido. En variados estudios se ha demostrado que bacterias aisladas del mismo individuo presentan actividad antagónica frente a diferentes patógenos, debido a esto se propone que bacterias aisladas del intestino de salmónidos tienen actividad antagónica contra bacterias de Piscirickettsia salmonis en su estado replicativo intracelular. Para evaluar esta hipótesis se aislaron bacterias del tracto intestinal de salmónidos y se evaluó la citotoxicidad de estos, seleccionando los aislados que fueron inocuos para las células RTgutGC. Por último, se evaluó la capacidad de estos aislados de inhibir o disminuir el crecimiento intracelular de Piscirickettsia salmonis.
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    Diseño de moléculas moduladoras del canal TRPV1 con inteligencia artificial
    (Universidad Andrés Bello, 2024) Roumeau Vial, Javier Ignacio.; Sepúlveda, Romina; Alegría Arcos, Melissa.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    El Receptor de Potencial Transitorio Vaniloide 1 (TRPV1) es un canal iónico que forma parte de la familia Receptor de Potencial Transitorio (TRP). Este canal se expresa en neuronas nociceptivas y está relacionado con el procesamiento de estímulos asociados al dolor agudo y crónico en patologías como artritis y migraña. El canal TRPV1 puede modularse por la unión de moléculas como Capsaicina al sitio de unión de vaniloides, encontrado en el dominio de transmembrana de la proteína. La unión genera la activación del canal, promoviendo el paso de cationes y un mecanismo de desensibilización provoca una disminución en la sensación de dolor, propiedad que ha generado interés en moduladores para este sitio. Sin embargo, los métodos tradicionales para el diseño de nuevos fármacos tienden a ser poco eficientes y de alto costo. Hoy en día, métodos de diseño de fármacos basados en inteligencia artificial tal como modelos basados en fragmentos y modelos del lenguaje se han incorporado en el diseño de compuestos y moléculas en un desarrollo más expedito y económico, el cual ha tenido resultados en la formulación de nuevos compuestos bioactivos. Para responder la necesidad del diseño de nuevas moléculas moduladoras de TRPV1 con potencial analgésico se propone un flujo de trabajo que incorpora la obtención y limpieza (o también llamada curación) de una base de datos de compuestos moduladores de TRPV1, la generación de moléculas usando dos herramientas que usan inteligencia artificial (CReM y GT4SD), el filtrado de moléculas candidatas usando algoritmos de Random Forest, el acoplamiento molecular de estas moléculas con TRPV1 y finalmente el análisis de estabilidad de interacciones usando simulaciones de dinámica molecular. Gracias a la integración de las distintas estrategias se postulan nuevas moléculas con potencial terapéutico.
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    Degradación de polímeros sintéticos por la bacteria antártica Pseudomonas veronii 68
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Rojas Morales, Fernanda Paz.; Pérez Donoso, José Manuel; Lagos Moraga, Sebastián Andrés.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    Los plásticos son polímeros sintéticos derivados de hidrocarburos conformados por cadenas de monómeros de carbono. El efecto antropogénico ha generado la fragmentación de estos polímeros, generando microplásticos altamente resistentes a la degradación. En este contexto, recientemente ha aumentado el interés en la biodegradación de los microplásticos mediante microorganismos, especialmente bacterias con enzimas capaces de descomponer estos polímeros en monómeros y generar productos que incorporan a su metabolismo. Previamente una bacteria aislada desde suelo Antártico contaminado con diésel (Pseudomonas veronii 68), presentó la capacidad de degradar derivados de hidrocarburos y utilizarlos como única fuente de carbono para su metabolismo. Debido a la similitud estructural de los hidrocarburos con los polímeros de plástico, el objetivo del presente estudio fue analizar la capacidad de P. veronii 68 de degradar plástico e identificar la presencia de genes que codifiquen para enzimas degradadoras de plástico en su genoma. Para comprender el proceso de degradación se analizó mediante herramientas bioinformáticas la presencia de enzimas con actividad hidrolasa como cutinasas, lipasas y esterasas. Se realizó un alineamiento con hidrolasas parcialmente caracterizadas donde se encontró una α/β-hidrolasa y una esterasa con un 40% y 78,8% de identidad, respectivamente. A partir de esto se identificó sitios catalíticos conservados y residuos aminoacídicos que permitieron realizar un docking con el fin de simular la interacción de estos residuos con los ligandos. Basándonos en estos resultados se puede sugerir que P. veronii 68 contiene enzimas que participan en la degradación de los polímeros sintéticos. Estos resultados son relevantes ya que podría tratarse de nuevas enzimas con la capacidad de degradar plásticos.
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    Descripción del neotipo de la ranita de Darwin del norte, Rhinoderma rufum (Philippi 1902)
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Roco Retamal, Giulianna Sophia.; Azat Soto, Claudio.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    Las ranitas de Darwin, Rhinoderma darwinii y R. rufum, son especies hermanas actualmente únicas en el mundo debido a su estrategia de cuidado parental, denominado neomelia, que consiste en que es el macho quien se encarga del cuidado de las crías al introducirlas en su saco bucal. Estas especies se distribuyen en la zona austral de Sudamérica, en ambientes templados, boscosos y húmedos o cercanos a arroyos, siendo R. rufum endémica sólo de Chile, mientras R. darwinii se distribuye igualmente en Argentina. Se han visto afectadas negativamente las poblaciones de ambas especies en las últimas décadas debido a diferentes factores, tanto ambientales, como el cambio climático, o humanos como lo son la destrucción de hábitat debido a plantaciones de árboles que reemplazan árboles nativos y el avance de la urbanización, sumado, igualmente, a la enfermedad infecciosa quitridiomicosis. Lo anterior ha dado como resultado el estado de En Peligro (EN) en el caso de R. darwinii y En Peligro Crítico (CR) y Posiblemente Extinta (PE) en el de R. rufum, que no se ha avistado desde la década de los ochenta. Es por la necesidad de definir el estatus taxonómico de R. rufum, sumado a la pérdida de su holotipo y primer neotipo, que es necesario redescribir otro neotipo para esta especie, para lo cual se procedió a la búsqueda en bases de datos de colecciones zoológicas del espécimen que cumpla con los caracteres morfológicos y morfométricos adecuados para ser propuesto como neotipo, según literatura científica y las condiciones dadas por la Comisión Internacional en Nomenclatura Zoológica. Como resultado se escogieron paratipos de la serie original del neotipo, pertenecientes al Muséum national d´Histoire naturelle (MNHN) de Paris. Concluyendo en la factibilidad de encontrar un neotipo con ayuda de material bibliográfico.
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    Diseño de agentes de transfección de ácidos nucleicos basados en péptidos autoensamblados
    (Universidad Andrés Bello, 2024) Robledo Ledesma, Favio Adolfo de Jesús; Márquez Miranda, Valeria.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    La transfección de ácidos nucleicos es una técnica relevante que permite el ingreso de material genético en las células, lo que abre puertas a la modificación génica incluyendo, expresión, inhibición y por ende terapias génicas de carácter terapéutico. Los vectores no virales han ganado reconocimiento debido a su baja inmunogenicidad y su potencial para ser utilizados de manera más segura en la terapia génica. Sin embargo, cuando se trabaja con ácidos nucleicos que no son convencionales como el siRNA, la elección de un vector adecuado presenta desafíos, ya que no todos son capaces de cumplir con los requisitos necesarios. En este contexto, los péptidos anfifílicos (PAs) surgen como candidatos prometedores para la entrega eficaz de ácidos nucleicos, como el siRNA, Su habilidad de autoensamblaje y síntesis sencilla destaca su potencial en este ámbito. Considerando esto, en este proyecto se propone como objetivo diseñar un péptido autoensamblable capaz de unirse eficientemente ácidos nucleicos, utilizando simulaciones de dinámica molecular. Para esto se utilizó el péptido autoensamblable FA32 y se buscó mejorar su afinidad de unión a ácidos nucleicos, mediante su modificación y adición de Arg, debido a la carga hidrofílica positiva de este aminoácido, la cual puede facilitar interacciones fuertes con los grupos fosfato cargados negativamente de los ácidos nucleicos. Para realizar este diseño de péptido se utilizaron simulaciones de dinámica molecular de grano grueso, para poder así estudiar el autoensamblaje de FA32 y sus interacciones con el ácido nucleico, generando las modificaciones que harán que aumente su eficiencia al unirse a la biomolécula de interés.
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    Evaluación de la estabilidad en el tiempo de un prototipo de solución inyectable para el tratamiento de ITU en animales de compañía
    (Universidad Andrés Bello, 2024) Oyarzún Aguilera, Martina Luján.; Bittner Ortega, Mauricio.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    Las infecciones del tracto urinario (ITU) afectan tanto a personas como a animales, siendo su principal causante Escherichia coli lo que lleva al uso de antibióticos para salir del cuadro infeccioso. Sin embargo, los tratamientos actuales han ido perdiendo efectividad por lo que el propósito de esta tesis es profundizar en la investigación sobre tratamientos con fagoterapia para infecciones del tracto urinario con el objetivo de evaluar la estabilidad de un prototipo de solución inyectable en el tiempo y a distintas temperaturas. Para lograr el objetivo propuesto es que se empleó un enfoque metodológico basado en estudios previos sobre el proceso de obtención de fagos, liofilización y posterior almacenamiento lo que permitió un análisis posterior de los resultados obtenidos. Se llevaron a cabo protocolos para la búsqueda de partículas virales en lugares donde estaba presente la bacteria E. coli, además del procesamiento de estas muestras se trabajó en paralelo con fagos para Salmonella Infantis y Salmonella Enteritidis por su similitud en el proceso infectivo del virus hacia la bacteria. El proceso de liofilización fue un aspecto clave para corroborar que el almacenamiento en seco de los fagos mantiene su viabilidad. En cambio, los resultados obtenidos a partir del análisis de un grupo de muestras de fagos reconstituidos posterior a su liofilización presentaron una diferencia importante a la hora de probar el prototipo con su bacteria objetivo. Se observó una disminución en la viabilidad de los bacteriófagos posterior a los 7 días de almacenaje, especialmente los que estuvieron expuestos a una temperatura de 37°C, lo que tendría implicaciones significativas en el campo de la terapia antimicrobiana. Esta investigación contribuye a mejorar el entendimiento de la estabilidad de un prototipo y cuáles serían condiciones ideales de conservación (temperatura) y cuánto puede llegar a durar una vez que el liofilizado se reconstituye (tiempo).
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    Caracterización de una cepa mutante de Botrytis Cinerea susceptible a la inhibición por hongos biocontroladores
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Ossa Rogat, Ignacio Alberto José.; Polanco O., Rubén; Canessa Águila, Paulo.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    Botrytis cinerea es un hongo necrotrófico causante de la enfermedad conocida como "podredumbre gris" en numerosos cultivos comerciales, ocasionando importantes pérdidas económicas para los agricultores. Por esta razón, se considera el segundo hongo fitopatógeno más relevante a nivel mundial. Actualmente, el método principal de control de B. cinerea es el uso de fungicidas químicos. Sin embargo, debido a los residuos que dejan en el medio ambiente, las restricciones en su uso y la baja eficacia debido a la resistencia desarrollada por el hongo, es necesario implementar otras alternativas para controlar a este fitopatógeno. La aplicación de organismos vivos, con capacidades antagónicas, se presenta como una herramienta de control poderosa frente a fitopatógenos. En este contexto, se han identificado organismos como Trichoderma atroviride, Chaetomium globosum y Clonostachys rosea, que poseen eficientes habilidades de micoparasitismo y antibiosis contra otros organismos. En esta Tesis, se utilizaron estos biocontroladores para estudiar la respuesta defensiva de una cepa mutante de B. cinerea “B07.68”, que demostró una menor capacidad de defensa frente a T. atroviride. El objetivo es determinar si esta respuesta reducida es específica para T. atroviride o se extiende a otros biocontroladores con un modo de acción similar. Para evitar la generación de variantes biológicas, las diferentes cepas usadas se mantendrán mediante criopreservación. Los resultados del estudio se basaron en el crecimiento radial en cultivos duales, el sobrecrecimiento entre individuos utilizando la escala de Bell y el porcentaje de inhibición del crecimiento (PIC), que se empleará para medir la actividad antibiótica sobre el fitopatógeno. Se obtuvieron 4 réplicas biológicas de cada enfrentamiento dual realizado en medio PDA, estos resultados demostraron una mayor susceptibilidad por parte de la cepa mutante de B. cinerea frente al micoparasitismo efectuado por T. atroviride y por C. rosea A y B. No se evidenciaron diferencias significativas ante el mecanismo de antibiosis efectuado por C. globosum y C. rosea MUT, permitiendo asociar la pérdida del gen ∆Bcin07g06800 a una respuesta defensiva específica al micoparasitismo.
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    Uso de cáscaras y membranas de huevo de pingüinos pygoscelis para la evaluación de diferencias latitudinales en la biodisponibilidad y contaminación por mercurio en la Antártica
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Núñez Pacheco, Ignacio Alonso.; Chiang Rojas, Gustavo.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    El mercurio se reconoce como un elemento potencialmente tóxico para el medio ambiente debido a sus propiedades elementales y ciclos biogeoquímicos, que le permiten infiltrarse en las tramas tróficas y causar daños fisiológicos, principalmente en el sistema nervioso, de los organismos. En el transcurso de la investigación, se cuantificó la concentración de mercurio en cáscaras de huevos de dos especies de pingüinos, Pygoscelis papua y Pygoscelis antarcticus, en dos bases de la Antártica: la Base Yelcho y la Base Bernardo O'Higgins. Se evaluó la influencia de la diferencia latitudinal en las concentraciones de mercurio. Durante el desarrollo de la investigación, se llevó a cabo la separación de la cáscara y la membrana de los huevos, las cuales fueron analizadas mediante DMA-80evo (Milestone) para cuantificar y representar gráficamente las concentraciones de mercurio. Los principales resultados obtenidos revelaron la ausencia de diferencias entre las cáscaras de ambas bases, pero se observaron concentraciones significativamente mayores de mercurio en las membranas de los huevos de pingüinos de la base Bernardo O'Higgins. Al analizar las diferencias entre especies, se evidenció que las membranas de Pygoscelis papua tenían mayores concentraciones de mercurio
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    Localización subcelular del ARN largo no codificante MALAT1 en modelo de células de cáncer gástrico y tiroideo
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Leiva Mena, Diego Alonso.; Aguilar Maureira, Rodrigo Agustín.; Facultad de Ciencias de la Vida.
    Los ARNs largos no codificantes (lncRNAs) son transcritos que permanecen generalmente en el núcleo. La desregulación de éstos transcritos está relacionado a enfermedades. Entre los lncRNAs hay un transcrito llamado MALAT1, el cuál desde su descubrimiento hace 20 años, ha sido encontrado sobreexpresado en docenas de tipos de cánceres distintos. Se ha localizado clásicamente a MALAT1 en el núcleo, sin embargo, un estudio reciente evidenció por medio de RNA-FISH que existe una localización aberrante de MALAT1 en las mitocondrias de la línea celular hepatocarcinoma HepG2. En esta tesis, se investiga la localización subcelular de MALAT1 en modelos de cáncer gástrico (células AGS) y de tiroides (células TPC1), hipotetizando que, en estas células, una fracción de los transcritos del lncRNA MALAT1 se localiza fuera del núcleo. Primero se realizó hibridación in situ fluorescente (RNA-FISH) para detectar MALAT1. Los resultados revelan que la población con localización de MALAT1 fuera del núcleo ascienden a un 10% en células de cáncer gástrico y 6% en células de cáncer de tiroides. Luego analizamos los niveles de transcrito de MALAT1 en extractos de RNA provenientes de fracciones subcelulares de las líneas celulares estudiadas, encontrando MALAT1 predominantemente en el núcleo de células de cáncer de tiroides, pero niveles comparables entre el citoplasma y núcleo de células de cáncer gástrico. Nuestros resultados abren puertas a la posibilidad que en una subpoblación de células cancerosas (especialmente en modelo de AGS de cáncer gástrico) MALAT1 pueda estar ejecutando funciones fuera del clásico contexto nuclear
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    Identificación molecular de los principales escolítidos presentes en las plantaciones de Pinus radiata de Forestal Arauco
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Reyes Valenzuela, Silvia Andrea; Carrasco, Angela; Ahumada, Rodrigo; Oliver Pavéz, María Isabel
    La propagación de insectos invasores para la industria forestal se ha vuelto cada vez más común durante las últimas décadas, trayendo importantes consecuencias económicas tanto en los países de origen como en los de destino. Frente a esto, los países afectados han establecido una serie de normativas fitosanitarias para evitar la introducción de otras especies de insectos, disminuir la propagación de las especies ya presentes y minimizar las pérdidas económicas. Para lograr esto, es necesaria una identificación oportuna y específica de las especies de escolítidos que están presentes en Chile y así poder orientar los métodos de control. Debido a lo anterior es que este trabajo tuvo como objetivo principal identificar las especies de escolítidos presentes en las plantaciones de Pinus radiata de Forestal Arauco mediante la aplicación de herramientas moleculares como el análisis de la secuencia del gen COI. Para esto, en primer lugar, se optimizó un protocolo de extracción de ADN, logrando resultados en poco tiempo, con buena concentración y pureza. Para la amplificación de la región barcode del gen COI, se probaron dos sets de partidores, obteniendo los mejores resultados con el set LCO1490/HC02198, lo que permitió una secuenciación con valores de calidad (HQ) superiores al 85%. Mediante este análisis, se logró identificar molecularmente tres especies de escolítidos de la corteza: Hylurgus ligniperda, Hylastes ater, Hylastes linearis y dos escarabajos de ambrosía: Xyleborinus saxesenii y Gnathotrupes sp. Finalmente, se construyó un árbol filogenético que confirmó la validez de las secuencias obtenidas en este trabajo.
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    Modulación de la respuesta inmune con glicolípidos activadores de células iNKT contenidos en liposomas en un modelo de alergia inducida por extractos de ácaro del polvo
    (Universidad Andrés Bello, 2023) Rojas Aguirre, Brian Alejandro; Carreño Márquez, Leandro Javier; García, Richard; Soto, Jorge; Facultad de Ciencias de la Vida
    El sistema inmune es una compleja red de órganos, tejidos, células y moléculas que se encargan de proteger el organismo contra agentes externos mediante la respuesta inmune. Esta respuesta se divide en dos: la inmunidad innata y la inmunidad adaptativa. Cuando hay un desequilibrio en la respuesta inmune, pueden surgir enfermedades autoinmunes y alérgicas, como es el caso del asma alérgica. Esta condición se caracteriza por una inflamación crónica de las vías respiratorias debido a una respuesta inmunitaria exacerbada. El asma alérgica es una enfermedad pulmonar inflamatoria crónica que afecta a millones de personas en todo el mundo. Aunque en la actualidad existen tratamientos para controlar los síntomas y reducir la inflamación, como los broncodilatadores y corticosteroides inhalados, todavía se necesitan nuevas terapias que aborden la respuesta inmunitaria de forma específica y efectiva. A nivel celular, la respuesta alérgica involucra la interacción de diversas células inmunitarias, como las células de la inmunidad innata, las células presentadoras de antígeno y los linfocitos T y B, además de la liberación de mediadores inflamatorios como la histamina, quimioquinas, citoquinas y leucotrienos. La exposición a alérgenos comunes, como los ácaros del polvo, desencadena una respuesta inmune exacerbada en personas atópicas, con elevados niveles de IgE en suero y producción aumentada de citoquinas de tipo Th2. En este trabajo se propuso dirigirse a células Natural Killer T invariantes (iNKT) para el tratamiento del asma alérgica. Se ha descrito que el uso de glicolípidos específicos, como el glicolípido alfa-galactosilceramida (α GalCer) induce la activación de las células iNKT. Esto induce la producción rápida de citoquinas mixtas con propiedades proinflamatorias y antiinflamatorias definidas como una respuesta similar a Th0 (IL-4/IFN-γ). Interesantemente, se han sintetizado varios análogos de αGalCer para inducir una respuesta de citoquinas polarizada, entre ellos AH10-7 y 7DW8-5. En este trabajo se buscó determinar si la activación de las células NKT con los análogos AH10-7 y 7DW8-5 tienen la capacidad de modular la respuesta alérgica. Los resultados obtenidos in vitro demuestran la eficacia de las formulaciones liposomales generadas para activar a las células iNKT de manera dosis dependiente. Además, cuando las preparaciones liposomales se administraron como tratamiento en el modelo de asma alérgica, se obtuvo que el tratamiento que contenía el glicolípido 7DW8-5 (Lp/Derp1/7DW8-5) provocó una disminución significativa de la población de eosinófilos y un aumento de la población de macrófagos intersticiales. Además de provocar una disminución en la infiltración de células inflamatorias, y, también una disminución de la inflamación de los bronquiolos. Estos resultados proporcionan aspectos atractivos para el uso del glicolípido 7DW8-5 contenido en liposomas como tratamiento del asma alérgica, sin embargo, aún faltan resultados más consistentes para determinar su eficacia.