Evaluación de rutas alostéricas de activación de unión de capsaicina como agonista del canal iónico TRPV1

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dc.contributor.advisorGonzález Nilo, Danilo
dc.contributor.advisorMárquez Miranda, Valeria
dc.contributor.authorBravo Acuña, Nicolás
dc.contributor.editorFacultad de Ciencias de la Vida
dc.date.accessioned2022-09-13T13:24:44Z
dc.date.available2022-09-13T13:24:44Z
dc.date.issued2022
dc.descriptionTesis (Magíster en Biotecnología y Ciencias de la Vida)es
dc.descriptionEsta investigación fue financiada por el proyecto FONDECYT 1170733 “Ligand and Temperature Activation in TRPV1 Channels: A Thermodynamics and Molecular Simulations Analysis”.
dc.description.abstractTRPV1 es un canal catiónico no selectivo, con una alta permeabilidad al calcio expresado en neuronas nociceptivas, que responde a estímulos físicos y químicos relacionados con la percepción del dolor como el calor nocivo. Originalmente fue designado como VR1 debido a que es receptor de compuestos vanilloides como capsaicina, principal componente picante del ají, que produce una sensación de dolor ardiente. La aplicación repetida de este compuesto puede desensibilizar el canal, lo que explica por qué presenta efectos analgésicos y tiene aplicaciones en el tratamiento del dolor. Las estructuras del canal determinadas a nivel atómico, obtenidas por cryo-EM, han permitido identificar los dominios de la proteína y las constricciones del poro, así como ciertos cambios conformacionales causados por calor, pH y ligandos. En 2020 se identificó por VS tres análogos de capsaicina, de los cuales dos tienen efectos analgésicos más rápidos y duraderos. Ya que estos compuestos tienen mayor afinidad por TRPV1 es oportuno poder evaluar los cambios conformacionales que provocan en el receptor. Con el propósito de estudiar la activación de TRPV1 por los análogos de capsaicina se recurrió a simulaciones computacionales. Se generaron modelos del canal completo de ardilla de tierra y se realizó acoplamiento molecular de los ligandos en el sitio de unión. Las mejores poses con el receptor en estado apo (cerrado) se utilizaron en simulaciones de dinámica molecular, alcanzando el microsegundo de producción. Nuestro modelo de sqTRPV1 demostró ser útil para la simulación molecular. Por otra parte, los ligandos no siempre adoptaron o permanecieron en conformaciones favorables para la apertura del canal. Se observó que el compuesto 1 provocó cambios conformacionales en el filtro de selectividad que permitieron el paso de un ion sin cruzar el sello hidrofóbico. Los resultados del presente trabajo sugieren que una misma molécula podría provocar cambios conformacionales en más de una cadena, llevando la señal alostérica por diferentes rutas al mismo destino.es
dc.identifier.urihttps://repositorio.unab.cl/xmlui/handle/ria/23855
dc.language.isoeses
dc.publisherUniversidad Andrés Belloes
dc.subjectCanales Iónicoses
dc.subjectCanales Catiónicos TRPV1es
dc.subjectCapsaicinaes
dc.titleEvaluación de rutas alostéricas de activación de unión de capsaicina como agonista del canal iónico TRPV1es
dc.typeTesises
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